RNA id: TCONS_00024682


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00024682
length 12378
lncRNA type antisense_over
GC content 0.36
exon number 3
gene id XLOC_011400
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007128.7
NCBI id CM002901.2
chromosome length 53461100
location 22559055 ~ 22572656 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
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TCONS_00024680 lncRNA upstream 855582 21667797 ~ 21703491 (+) True XLOC_011389
TCONS_00024467 lncRNA upstream 1468961 21089774 ~ 21090112 (+) True XLOC_011381
TCONS_00024679 lncRNA upstream 1572697 20979252 ~ 20986376 (+) True XLOC_011380
TCONS_00024678 lncRNA upstream 1618242 20938254 ~ 20940831 (+) True XLOC_011379
TCONS_00022711 lncRNA downstream 649521 23222177 ~ 23232294 (+) True XLOC_011407
TCONS_00024683 lncRNA downstream 830466 23403122 ~ 23404188 (+) True XLOC_011422
TCONS_00024684 lncRNA downstream 837039 23409695 ~ 23410985 (+) True XLOC_011423
TCONS_00022731 lncRNA downstream 898464 23471120 ~ 23473164 (+) False XLOC_011425
TCONS_00022732 lncRNA downstream 908395 23481051 ~ 23482621 (+) False XLOC_011425
TCONS_00022699 mRNA upstream 16863 22530820 ~ 22542210 (+) True XLOC_011399
TCONS_00022696 mRNA upstream 57103 22311413 ~ 22501970 (+) False XLOC_011398
TCONS_00022697 mRNA upstream 58224 22381215 ~ 22500849 (+) False XLOC_011398
TCONS_00022698 mRNA upstream 58317 22381248 ~ 22500756 (+) True XLOC_011398
TCONS_00022695 mRNA upstream 452532 22102791 ~ 22106541 (+) True XLOC_011397
TCONS_00022701 mRNA downstream 4816 22577472 ~ 22585596 (+) False XLOC_011401
TCONS_00022703 mRNA downstream 14700 22587356 ~ 22741729 (+) True XLOC_011402
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TCONS_00022705 mRNA downstream 187553 22760209 ~ 22810625 (+) False XLOC_011403
TCONS_00022708 mRNA downstream 383771 22956427 ~ 23095090 (+) False XLOC_011405
TCONS_00022689 other upstream 641509 21917448 ~ 21917564 (+) True XLOC_011392
TCONS_00022679 other upstream 951364 21564607 ~ 21607709 (+) True XLOC_011388
TCONS_00022668 other upstream 1928758 20625773 ~ 20630315 (+) True XLOC_011374
TCONS_00022664 other upstream 1932254 20616016 ~ 20626819 (+) False XLOC_011374
TCONS_00022702 other downstream 4974 22577630 ~ 22580193 (+) True XLOC_011401
TCONS_00022706 other downstream 188077 22760733 ~ 22782721 (+) True XLOC_011403
TCONS_00022707 other downstream 254407 22827063 ~ 22827147 (+) True XLOC_011404
TCONS_00022712 other downstream 651148 23223804 ~ 23223920 (+) True XLOC_011408
TCONS_00022717 other downstream 757515 23330171 ~ 23330311 (+) True XLOC_011412

Expression Profile

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