RNA id: TCONS_00023083



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00023083
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.57
exon number 1
gene id XLOC_011599
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007128.7
NCBI id CM002901.2
chromosome length 53461100
location 37272019 ~ 37272133 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ATCGGCAGCTGGCTGTCTGCaattctcacatggtcgcccactgaagctaagcagggctgagcctggtcagtacctggatgggagaccacatgagaaagccagattgctgccggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000182417

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00023079 lncRNA upstream 36949 37227990 ~ 37235070 (+) True XLOC_011596
TCONS_00024722 lncRNA upstream 1714457 35556312 ~ 35557562 (+) True XLOC_011590
TCONS_00023070 lncRNA upstream 1983278 35278788 ~ 35288741 (+) False XLOC_011587
TCONS_00024721 lncRNA upstream 1983278 35281526 ~ 35288741 (+) True XLOC_011587
TCONS_00023069 lncRNA upstream 2027549 35243765 ~ 35244470 (+) True XLOC_011586
TCONS_00024723 lncRNA downstream 108367 37380500 ~ 37398410 (+) False XLOC_011601
TCONS_00024724 lncRNA downstream 123708 37395841 ~ 37398410 (+) True XLOC_011601
TCONS_00023088 lncRNA downstream 238675 37510808 ~ 37549455 (+) False XLOC_011603
TCONS_00023090 lncRNA downstream 238888 37511021 ~ 37571301 (+) False XLOC_011603
TCONS_00023093 lncRNA downstream 352711 37624844 ~ 37646138 (+) False XLOC_011604
TCONS_00023080 mRNA upstream 17753 37249736 ~ 37254266 (+) True XLOC_011597
TCONS_00023078 mRNA upstream 19209 37227936 ~ 37252810 (+) False XLOC_011596
TCONS_00023077 mRNA upstream 50975 37215820 ~ 37221044 (+) True XLOC_011595
TCONS_00023076 mRNA upstream 590279 36627099 ~ 36681740 (+) True XLOC_011594
TCONS_00023074 mRNA upstream 682414 36588281 ~ 36589605 (+) True XLOC_011592
TCONS_00023085 mRNA downstream 29727 37301860 ~ 37365668 (+) False XLOC_011600
TCONS_00023084 mRNA downstream 29727 37301860 ~ 37365668 (+) False XLOC_011600
TCONS_00023086 mRNA downstream 38530 37310663 ~ 37365578 (+) True XLOC_011600
TCONS_00023089 mRNA downstream 238701 37510834 ~ 37618891 (+) False XLOC_011603
TCONS_00023091 mRNA downstream 238959 37511092 ~ 37615881 (+) True XLOC_011603
TCONS_00023075 other upstream 657587 36614315 ~ 36614432 (+) True XLOC_011593
TCONS_00023073 other upstream 1356893 35915010 ~ 35915126 (+) True XLOC_011591
TCONS_00023050 other upstream 3686557 33585346 ~ 33585462 (+) True XLOC_011577
TCONS_00023034 other upstream 3973549 33298348 ~ 33298470 (+) True XLOC_011569
TCONS_00023028 other upstream 4098866 33158294 ~ 33173153 (+) False XLOC_011566
TCONS_00023087 other downstream 181543 37453676 ~ 37453807 (+) True XLOC_011602
TCONS_00023113 other downstream 2153959 39426092 ~ 39426212 (+) True XLOC_011624
TCONS_00023114 other downstream 2420449 39692582 ~ 39692696 (+) True XLOC_011626
TCONS_00023119 other downstream 2499355 39771488 ~ 39771585 (+) False XLOC_011629
TCONS_00023120 other downstream 2506514 39778647 ~ 39778744 (+) True XLOC_011629

Expression Profile


//