RNA id: TCONS_00023133


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00023133
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_011645
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007128.7
NCBI id CM002901.2
chromosome length 53461100
location 41759808 ~ 41759925 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGCcaaagccatatcaccctgcagcccaagattgGTTACTCacggaagctaagcagggctgagtctaGTCAGCACCTCGATGGGAGACCCCATTGGGAAAACTAAGTAGCTTTTAgat

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000116613

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00024738 lncRNA upstream 281171 41475151 ~ 41478637 (+) True XLOC_011644
TCONS_00024494 lncRNA upstream 759947 40989973 ~ 40999861 (+) False XLOC_011639
TCONS_00024483 lncRNA upstream 1265952 40486306 ~ 40493856 (+) False XLOC_011637
TCONS_00024493 lncRNA upstream 1266940 40488763 ~ 40492868 (+) True XLOC_011637
TCONS_00024491 lncRNA upstream 1267142 40488252 ~ 40492666 (+) False XLOC_011637
TCONS_00024739 lncRNA downstream 2260 41762185 ~ 41763364 (+) False XLOC_011646
TCONS_00023134 lncRNA downstream 2358 41762283 ~ 41763364 (+) True XLOC_011646
TCONS_00024740 lncRNA downstream 522929 42282854 ~ 42286980 (+) False XLOC_011649
TCONS_00024741 lncRNA downstream 523407 42283332 ~ 42286980 (+) True XLOC_011649
TCONS_00024495 lncRNA downstream 591560 42351485 ~ 42352915 (+) False XLOC_011650
TCONS_00023132 mRNA upstream 293663 41463942 ~ 41466145 (+) True XLOC_011643
TCONS_00023130 mRNA upstream 390978 41337246 ~ 41368830 (+) False XLOC_011642
TCONS_00023131 mRNA upstream 390978 41343167 ~ 41368830 (+) True XLOC_011642
TCONS_00023129 mRNA upstream 441261 41302660 ~ 41318547 (+) True XLOC_011641
TCONS_00023126 mRNA upstream 493247 41081512 ~ 41266561 (+) False XLOC_011640
TCONS_00023135 mRNA downstream 232129 41992054 ~ 42044980 (+) False XLOC_011647
TCONS_00023136 mRNA downstream 232202 41992127 ~ 42045253 (+) False XLOC_011647
TCONS_00023137 mRNA downstream 268044 42027969 ~ 42045142 (+) True XLOC_011647
TCONS_00023138 mRNA downstream 514315 42274240 ~ 42277902 (+) False XLOC_011648
TCONS_00023139 mRNA downstream 514900 42274825 ~ 42278340 (+) True XLOC_011648
TCONS_00023121 other upstream 1973896 39785815 ~ 39785912 (+) True XLOC_011630
TCONS_00023120 other upstream 1981064 39778647 ~ 39778744 (+) True XLOC_011629
TCONS_00023119 other upstream 1988223 39771488 ~ 39771585 (+) False XLOC_011629
TCONS_00023114 other upstream 2067112 39692582 ~ 39692696 (+) True XLOC_011626
TCONS_00023113 other upstream 2333596 39426092 ~ 39426212 (+) True XLOC_011624
TCONS_00023158 other downstream 2103807 43863732 ~ 43874284 (+) False XLOC_011668
TCONS_00023173 other downstream 2182012 43941937 ~ 43942051 (+) True XLOC_011671
TCONS_00023179 other downstream 2531480 44291405 ~ 44291520 (+) True XLOC_011677
TCONS_00023189 other downstream 3250118 45010043 ~ 45011856 (+) False XLOC_011685
TCONS_00023200 other downstream 3636169 45396094 ~ 45402959 (+) True XLOC_011692