RNA id: TCONS_00023179


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00023179
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.56
exon number 1
gene id XLOC_011677
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007128.7
NCBI id CM002901.2
chromosome length 53461100
location 44291405 ~ 44291520 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GCTGgctgctagctctctgcaactctcacatggtcgccccactgaagctaagcagggctgcttccggtcagtacctggatgggagaccacatgcaAAATcttggttgctgctggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000193096

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00024756 lncRNA upstream 28586 44258051 ~ 44262819 (+) True XLOC_011676
TCONS_00023178 lncRNA upstream 35478 44249450 ~ 44255927 (+) False XLOC_011675
TCONS_00024753 lncRNA upstream 35478 44249609 ~ 44255927 (+) False XLOC_011675
TCONS_00024754 lncRNA upstream 35478 44249825 ~ 44255927 (+) False XLOC_011675
TCONS_00024755 lncRNA upstream 35478 44250176 ~ 44255927 (+) True XLOC_011675
TCONS_00024757 lncRNA downstream 90813 44382333 ~ 44392787 (+) True XLOC_011678
TCONS_00024758 lncRNA downstream 470104 44761624 ~ 44763410 (+) True XLOC_011683
TCONS_00023185 lncRNA downstream 488839 44780359 ~ 44834423 (+) False XLOC_011684
TCONS_00023187 lncRNA downstream 608021 44899541 ~ 44922142 (+) True XLOC_011684
TCONS_00023194 lncRNA downstream 886106 45177626 ~ 45180746 (+) False XLOC_011687
TCONS_00023176 mRNA upstream 96520 44115441 ~ 44194885 (+) False XLOC_011674
TCONS_00023177 mRNA upstream 99461 44115484 ~ 44191944 (+) True XLOC_011674
TCONS_00023175 mRNA upstream 210672 44030692 ~ 44080733 (+) True XLOC_011673
TCONS_00023171 mRNA upstream 289373 43926523 ~ 44002032 (+) False XLOC_011670
TCONS_00023172 mRNA upstream 289388 43926560 ~ 44002017 (+) False XLOC_011670
TCONS_00023180 mRNA downstream 149522 44441042 ~ 44454022 (+) True XLOC_011679
TCONS_00023181 mRNA downstream 171710 44463230 ~ 44476712 (+) True XLOC_011680
TCONS_00023182 mRNA downstream 406084 44697604 ~ 44752439 (+) True XLOC_011681
TCONS_00023183 mRNA downstream 464727 44756247 ~ 44761580 (+) True XLOC_011682
TCONS_00023184 mRNA downstream 488646 44780166 ~ 44923661 (+) False XLOC_011684
TCONS_00023173 other upstream 349354 43941937 ~ 43942051 (+) True XLOC_011671
TCONS_00023158 other upstream 417121 43863732 ~ 43874284 (+) False XLOC_011668
TCONS_00023133 other upstream 2531480 41759808 ~ 41759925 (+) True XLOC_011645
TCONS_00023121 other upstream 4505493 39785815 ~ 39785912 (+) True XLOC_011630
TCONS_00023120 other upstream 4512661 39778647 ~ 39778744 (+) True XLOC_011629
TCONS_00023189 other downstream 718523 45010043 ~ 45011856 (+) False XLOC_011685
TCONS_00023200 other downstream 1104574 45396094 ~ 45402959 (+) True XLOC_011692
TCONS_00023207 other downstream 1181134 45472654 ~ 45475249 (+) False XLOC_011696
TCONS_00023216 other downstream 1347822 45639342 ~ 45646531 (+) True XLOC_011699
TCONS_00023224 other downstream 1456163 45747683 ~ 45748668 (+) False XLOC_011701