RNA id: TCONS_00023233



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00023233
length 784
RNA type mRNA
GC content 0.58
exon number 5
gene id XLOC_011707
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007128.7
NCBI id CM002901.2
chromosome length 53461100
location 46739693 ~ 46740881 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


agacttgtacctgaagggcccgttgctgggacgaggtggattcggctctgtgtttgctgggatgcgcaggtctgatggactgccagtggccatcaagtatgtgtcgaaggaccggacccccgagcgactgaaagttgatggtcagggtcggctgccgctggaggtggcattgatgacccgtgtcacgtcagctcctgcctgccccagtgtcctgctgctgctggactggtttgaccgtcccagacgctacatcctgatcctggagcgaccggatccttgccaagatctccagagcttctgtgaggagaacggctgtctggatgagcgtctggccaagaaagtgctggtgcagctgatcgcggccctaaaacactgcgagagccgcggcgtcctgcaccgggacgtcaaaccagaaaacctgctgatctccacagagtcccaggacatcaagctgctggacttcggctgtggagatctgctgaagcgctcggcctacaaatactttgcaggcactcctgcatacgctcctcctgagtggtttcgtagacatcgctaccatgcgactccagctacagtctggtcagtaggagtgacgctctacaacatcctgtgtgaccgtttcccattcagaggcgcacagagggtcacgtccagaagccgactgaccttccctaggagcttgtcaacagagtgccgtcagctgattcgctggtgtctcagtgcagcaccggctgatcggcccagtttagatgacattgagagccatccctggttgcactgcaca

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000097810

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00024763 lncRNA upstream 275517 46455790 ~ 46464176 (+) True XLOC_011706
TCONS_00024499 lncRNA upstream 559456 46172679 ~ 46180237 (+) True XLOC_011704
TCONS_00023215 lncRNA upstream 1099397 45639339 ~ 45640296 (+) False XLOC_011699
TCONS_00023211 lncRNA upstream 1158065 45580627 ~ 45581628 (+) True XLOC_011697
TCONS_00023210 lncRNA upstream 1158728 45577357 ~ 45580965 (+) False XLOC_011697
TCONS_00024764 lncRNA downstream 2415 46743296 ~ 46825416 (+) True XLOC_011708
TCONS_00023236 lncRNA downstream 110145 46851026 ~ 46854102 (+) True XLOC_011711
TCONS_00023238 lncRNA downstream 171009 46911890 ~ 46920595 (+) True XLOC_011713
TCONS_00024500 lncRNA downstream 379398 47120279 ~ 47122203 (+) False XLOC_011716
TCONS_00024765 lncRNA downstream 380268 47121149 ~ 47122203 (+) True XLOC_011716
TCONS_00023231 mRNA upstream 300441 46387086 ~ 46439252 (+) False XLOC_011705
TCONS_00023228 mRNA upstream 750227 45817527 ~ 45989466 (+) False XLOC_011703
TCONS_00023223 mRNA upstream 964683 45738098 ~ 45775010 (+) False XLOC_011701
TCONS_00023234 mRNA downstream 77640 46818521 ~ 46820429 (+) True XLOC_011709
TCONS_00023237 mRNA downstream 123235 46864116 ~ 46866095 (+) True XLOC_011712
TCONS_00023239 mRNA downstream 194180 46935061 ~ 46936696 (+) True XLOC_011714
TCONS_00023240 mRNA downstream 349616 47090497 ~ 47130903 (+) False XLOC_011715
TCONS_00023241 mRNA downstream 349616 47090497 ~ 47237876 (+) False XLOC_011715
TCONS_00023232 other upstream 303460 46387217 ~ 46436233 (+) True XLOC_011705
TCONS_00023229 other upstream 784630 45915031 ~ 45955063 (+) False XLOC_011703
TCONS_00023230 other upstream 816793 45915111 ~ 45922900 (+) True XLOC_011703
TCONS_00023227 other upstream 921216 45815353 ~ 45818477 (+) False XLOC_011703
TCONS_00023226 other upstream 931445 45808153 ~ 45808248 (+) True XLOC_011702
TCONS_00023235 other downstream 108368 46849249 ~ 46849346 (+) True XLOC_011710
TCONS_00023244 other downstream 456995 47197876 ~ 47197992 (+) True XLOC_011717
TCONS_00023246 other downstream 650636 47391517 ~ 47391634 (+) True XLOC_011719
TCONS_00023279 other downstream 2769985 49510866 ~ 49511000 (+) True XLOC_011737
TCONS_00023326 other downstream 5167190 51908071 ~ 51908186 (+) True XLOC_011771

Expression Profile


//