RNA id: TCONS_00023326


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00023326
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.55
exon number 1
gene id XLOC_011771
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007128.7
NCBI id CM002901.2
chromosome length 53461100
location 51908071 ~ 51908186 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGTtgtcagctagctctctgcaactctcacatggtcatccactgaagctaagcagggctgcgctcgGTTagtgcctggatgggagaccacatgggaaagctaggttgctgcgggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000178018

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00024783 lncRNA upstream 82589 51821696 ~ 51825482 (+) False XLOC_011769
TCONS_00024784 lncRNA upstream 82589 51821762 ~ 51825482 (+) False XLOC_011769
TCONS_00024785 lncRNA upstream 82589 51821874 ~ 51825482 (+) False XLOC_011769
TCONS_00024786 lncRNA upstream 82589 51822280 ~ 51825482 (+) True XLOC_011769
TCONS_00024782 lncRNA upstream 149565 51757892 ~ 51758506 (+) True XLOC_011767
TCONS_00024787 lncRNA downstream 87925 51996111 ~ 52053951 (+) False XLOC_011772
TCONS_00024507 lncRNA downstream 139855 52048041 ~ 52053951 (+) True XLOC_011772
TCONS_00024788 lncRNA downstream 221506 52129692 ~ 52130818 (+) True XLOC_011773
TCONS_00024789 lncRNA downstream 223110 52131296 ~ 52135039 (+) True XLOC_011774
TCONS_00024508 lncRNA downstream 363111 52271297 ~ 52272517 (+) True XLOC_011775
TCONS_00023323 mRNA upstream 118323 51764310 ~ 51789748 (+) True XLOC_011768
TCONS_00023320 mRNA upstream 147828 51744450 ~ 51760243 (+) False XLOC_011767
TCONS_00023318 mRNA upstream 150520 51743908 ~ 51757551 (+) False XLOC_011767
TCONS_00023322 mRNA upstream 150937 51746830 ~ 51757134 (+) False XLOC_011767
TCONS_00023319 mRNA upstream 156833 51744012 ~ 51751238 (+) False XLOC_011767
TCONS_00023327 mRNA downstream 32582 51940768 ~ 52053880 (+) False XLOC_011772
TCONS_00023328 mRNA downstream 391832 52300018 ~ 52386518 (+) True XLOC_011776
TCONS_00023330 mRNA downstream 616266 52524452 ~ 52553447 (+) False XLOC_011778
TCONS_00023334 mRNA downstream 704680 52612866 ~ 52631314 (+) False XLOC_011780
TCONS_00023333 mRNA downstream 704680 52612866 ~ 52631314 (+) False XLOC_011780
TCONS_00023279 other upstream 2397071 49510866 ~ 49511000 (+) True XLOC_011737
TCONS_00023246 other upstream 4516437 47391517 ~ 47391634 (+) True XLOC_011719
TCONS_00023244 other upstream 4710079 47197876 ~ 47197992 (+) True XLOC_011717
TCONS_00023235 other upstream 5058725 46849249 ~ 46849346 (+) True XLOC_011710
TCONS_00023232 other upstream 5471838 46387217 ~ 46436233 (+) True XLOC_011705
TCONS_00023329 other downstream 616169 52524355 ~ 52537436 (+) False XLOC_011778
TCONS_00023331 other downstream 620312 52528498 ~ 52531702 (+) False XLOC_011778
TCONS_00023332 other downstream 626380 52534566 ~ 52552933 (+) True XLOC_011778
TCONS_00023337 other downstream 716661 52624847 ~ 52630072 (+) True XLOC_011780
TCONS_00023367 other downstream 1523086 53431272 ~ 53444454 (+) False XLOC_011802