RNA id: TCONS_00024957


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00024957
length 3340
lncRNA type antisense_over
GC content 0.31
exon number 2
gene id XLOC_012273
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007128.7
NCBI id CM002901.2
chromosome length 53461100
location 38023143 ~ 38026611 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

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Function

GO:

id name namespace
GO:0005615 extracellular space cellular_component

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00024955 lncRNA downstream 251803 37768641 ~ 37771340 (-) True XLOC_012271
TCONS_00024173 lncRNA downstream 627696 37387979 ~ 37395447 (-) True XLOC_012268
TCONS_00024954 lncRNA downstream 657786 37363024 ~ 37365357 (-) True XLOC_012267
TCONS_00024167 lncRNA downstream 723762 37291455 ~ 37299381 (-) True XLOC_012264
TCONS_00024141 lncRNA downstream 1347266 36673484 ~ 36675877 (-) True XLOC_012253
TCONS_00024958 lncRNA upstream 686015 38712626 ~ 38714935 (-) True XLOC_012276
TCONS_00024183 lncRNA upstream 728123 38754734 ~ 38760657 (-) False XLOC_012277
TCONS_00024959 lncRNA upstream 1473961 39500572 ~ 39547487 (-) True XLOC_012282
TCONS_00024960 lncRNA upstream 1838270 39864881 ~ 39866039 (-) True XLOC_012289
TCONS_00024961 lncRNA upstream 1982765 40009376 ~ 40022224 (-) False XLOC_012291
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TCONS_00024175 mRNA downstream 548454 37445525 ~ 37474689 (-) True XLOC_012270
TCONS_00024172 mRNA downstream 627647 37385811 ~ 37395496 (-) False XLOC_012268
TCONS_00024171 mRNA downstream 627683 37385811 ~ 37395460 (-) False XLOC_012268
TCONS_00024170 mRNA downstream 710221 37310663 ~ 37312922 (-) True XLOC_012266
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TCONS_00024177 mRNA upstream 209858 38236469 ~ 38244117 (-) False XLOC_012274
TCONS_00024179 mRNA upstream 216332 38242943 ~ 38291065 (-) True XLOC_012274
TCONS_00024180 mRNA upstream 366578 38393189 ~ 38442362 (-) True XLOC_012275
TCONS_00024181 mRNA upstream 712229 38738840 ~ 38778826 (-) False XLOC_012277
TCONS_00024174 other downstream 633026 37390003 ~ 37390117 (-) True XLOC_012269
TCONS_00024169 other downstream 711333 37310662 ~ 37311810 (-) False XLOC_012266
TCONS_00024168 other downstream 713697 37309329 ~ 37309446 (-) True XLOC_012265
TCONS_00024159 other downstream 1072588 36950438 ~ 36950555 (-) True XLOC_012260
TCONS_00024140 other downstream 1387954 36635072 ~ 36635189 (-) True XLOC_012252
TCONS_00024188 other upstream 960685 38987296 ~ 38987415 (-) True XLOC_012280
TCONS_00024189 other upstream 1122956 39149567 ~ 39149683 (-) True XLOC_012281
TCONS_00024190 other upstream 1505204 39531815 ~ 39531929 (-) True XLOC_012283
TCONS_00024191 other upstream 1615070 39641681 ~ 39641798 (-) True XLOC_012284
TCONS_00024224 other upstream 4798680 42825291 ~ 42842863 (-) True XLOC_012313

Expression Profile

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