RNA id: TCONS_00025594


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00025594
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.45
exon number 1
gene id XLOC_012828
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 26747811 ~ 26747927 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ATTTACAGCCATATCACTCTACAGCAAAAGACTGGTTATTTACTGAAGCtatgcagggctgagcctggtcagtacctggatgggagaccacatgtgaaaactaggttgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000175472

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00027119 lncRNA upstream 286384 26456681 ~ 26461427 (+) True XLOC_012825
TCONS_00026901 lncRNA upstream 1248203 25477794 ~ 25499608 (+) True XLOC_012816
TCONS_00026903 lncRNA upstream 1251200 25492659 ~ 25496611 (+) False XLOC_012817
TCONS_00027118 lncRNA upstream 1252953 25492733 ~ 25494858 (+) True XLOC_012817
TCONS_00026902 lncRNA upstream 1254053 25492411 ~ 25493758 (+) False XLOC_012817
TCONS_00026904 lncRNA downstream 249649 26997576 ~ 26998589 (+) True XLOC_012832
TCONS_00025618 lncRNA downstream 823561 27571488 ~ 27614703 (+) False XLOC_012839
TCONS_00025634 lncRNA downstream 2408900 29156827 ~ 29174491 (+) False XLOC_012848
TCONS_00025635 lncRNA downstream 2408922 29156849 ~ 29163114 (+) False XLOC_012848
TCONS_00025646 lncRNA downstream 3381844 30129771 ~ 30131831 (+) False XLOC_012854
TCONS_00025592 mRNA upstream 19185 26719787 ~ 26728626 (+) True XLOC_012826
TCONS_00025589 mRNA upstream 294082 26428829 ~ 26453729 (+) False XLOC_012824
TCONS_00025588 mRNA upstream 294112 26428829 ~ 26453699 (+) False XLOC_012824
TCONS_00025587 mRNA upstream 294112 26428829 ~ 26453699 (+) False XLOC_012824
TCONS_00025590 mRNA upstream 310809 26429428 ~ 26437002 (+) False XLOC_012824
TCONS_00025595 mRNA downstream 2589 26750516 ~ 26755230 (+) True XLOC_012827
TCONS_00025596 mRNA downstream 81159 26829086 ~ 26850069 (+) False XLOC_012829
TCONS_00025597 mRNA downstream 81435 26829362 ~ 26849768 (+) True XLOC_012829
TCONS_00025598 mRNA downstream 148067 26895994 ~ 26896826 (+) True XLOC_012830
TCONS_00025599 mRNA downstream 151389 26899316 ~ 26920132 (+) True XLOC_012831
TCONS_00025591 other upstream 316626 26429665 ~ 26431185 (+) True XLOC_012824
TCONS_00025586 other upstream 321174 26425139 ~ 26426637 (+) True XLOC_012823
TCONS_00025570 other upstream 2007090 24737379 ~ 24740721 (+) False XLOC_012812
TCONS_00025571 other upstream 2007637 24737959 ~ 24740174 (+) False XLOC_012812
TCONS_00025567 other upstream 2007764 24737360 ~ 24740047 (+) False XLOC_012812
TCONS_00025607 other downstream 448283 27196210 ~ 27196326 (+) True XLOC_012835
TCONS_00025621 other downstream 988797 27736724 ~ 27736840 (+) True XLOC_012841
TCONS_00025628 other downstream 1555964 28303891 ~ 28304317 (+) True XLOC_012845
TCONS_00025637 other downstream 2427166 29175093 ~ 29175208 (+) True XLOC_012849
TCONS_00025648 other downstream 3381872 30129799 ~ 30130552 (+) False XLOC_012854