RNA id: TCONS_00026288


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00026288
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_013286
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 12945617 ~ 12945731 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

AAAAGCAGCTTGCTCCCTGCAACTCTCTCAttgttgcccactgaagctaagcatggctgtggccagtcagtacctggatgggagaccacatggggaagctaggttgctgctgtaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000189941

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00027273 lncRNA downstream 82094 12862604 ~ 12863523 (-) True XLOC_013284
TCONS_00027272 lncRNA downstream 582288 12358383 ~ 12363329 (-) True XLOC_013278
TCONS_00026957 lncRNA downstream 591343 12346296 ~ 12354274 (-) False XLOC_013277
TCONS_00027271 lncRNA downstream 591429 12351884 ~ 12354188 (-) True XLOC_013277
TCONS_00027270 lncRNA downstream 1229295 11713285 ~ 11716322 (-) True XLOC_013273
TCONS_00027274 lncRNA upstream 132112 13077843 ~ 13114318 (-) True XLOC_013288
TCONS_00026294 lncRNA upstream 335923 13281654 ~ 13287651 (-) True XLOC_013291
TCONS_00027275 lncRNA upstream 1818172 14763903 ~ 14765883 (-) True XLOC_013300
TCONS_00027276 lncRNA upstream 2242286 15188017 ~ 15191812 (-) True XLOC_013310
TCONS_00026327 lncRNA upstream 2350305 15296036 ~ 15311911 (-) False XLOC_013312
TCONS_00026285 mRNA downstream 87601 12839126 ~ 12858016 (-) True XLOC_013283
TCONS_00026281 mRNA downstream 291606 12464945 ~ 12654011 (-) True XLOC_013280
TCONS_00026280 mRNA downstream 332918 12464461 ~ 12612699 (-) False XLOC_013280
TCONS_00026278 mRNA downstream 493845 12364733 ~ 12451772 (-) False XLOC_013279
TCONS_00026277 mRNA downstream 529598 12364733 ~ 12416019 (-) False XLOC_013279
TCONS_00026289 mRNA upstream 117479 13063210 ~ 13121983 (-) True XLOC_013287
TCONS_00026290 mRNA upstream 177992 13123723 ~ 13133268 (-) True XLOC_013289
TCONS_00026291 mRNA upstream 250014 13195745 ~ 13203351 (-) False XLOC_013290
TCONS_00026292 mRNA upstream 255938 13201669 ~ 13203351 (-) False XLOC_013290
TCONS_00026293 mRNA upstream 255938 13201669 ~ 13203401 (-) True XLOC_013290
TCONS_00026284 other downstream 180165 12761610 ~ 12765452 (-) True XLOC_013282
TCONS_00026283 other downstream 182925 12760802 ~ 12762692 (-) False XLOC_013282
TCONS_00026282 other downstream 413457 12532046 ~ 12532160 (-) True XLOC_013281
TCONS_00026279 other downstream 492067 12451709 ~ 12453550 (-) True XLOC_013279
TCONS_00026267 other downstream 1628636 11281593 ~ 11316981 (-) True XLOC_013270
TCONS_00026297 other upstream 531371 13477102 ~ 13478222 (-) True XLOC_013293
TCONS_00026298 other upstream 598519 13544250 ~ 13544367 (-) True XLOC_013294
TCONS_00026302 other upstream 1390896 14336627 ~ 14337458 (-) True XLOC_013296
TCONS_00026312 other upstream 1920652 14866383 ~ 14871136 (-) True XLOC_013303
TCONS_00026322 other upstream 2090420 15036151 ~ 15036269 (-) True XLOC_013308