RNA id: TCONS_00026298



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00026298
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_013294
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 13544250 ~ 13544367 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


CGTAACGTTACATATCACCCTGCTGCCCAATAccggttacttactgaagctaaggagggctgagcctggtcagtacctggatgggagaccacatgggaaaactaggttgctgttggat

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000120869

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00026294 lncRNA downstream 256599 13281654 ~ 13287651 (-) True XLOC_013291
TCONS_00027274 lncRNA downstream 429932 13077843 ~ 13114318 (-) True XLOC_013288
TCONS_00027273 lncRNA downstream 680727 12862604 ~ 12863523 (-) True XLOC_013284
TCONS_00027272 lncRNA downstream 1180921 12358383 ~ 12363329 (-) True XLOC_013278
TCONS_00027271 lncRNA downstream 1190062 12351884 ~ 12354188 (-) True XLOC_013277
TCONS_00027275 lncRNA upstream 1219536 14763903 ~ 14765883 (-) True XLOC_013300
TCONS_00027276 lncRNA upstream 1643650 15188017 ~ 15191812 (-) True XLOC_013310
TCONS_00026327 lncRNA upstream 1751669 15296036 ~ 15311911 (-) False XLOC_013312
TCONS_00026328 lncRNA upstream 1774019 15318386 ~ 15320930 (-) True XLOC_013312
TCONS_00026330 lncRNA upstream 1823133 15367500 ~ 15370455 (-) True XLOC_013313
TCONS_00026296 mRNA downstream 181324 13326724 ~ 13362926 (-) True XLOC_013292
TCONS_00026295 mRNA downstream 184144 13324140 ~ 13360106 (-) False XLOC_013292
TCONS_00026293 mRNA downstream 340849 13201669 ~ 13203401 (-) True XLOC_013290
TCONS_00026291 mRNA downstream 340899 13195745 ~ 13203351 (-) False XLOC_013290
TCONS_00026299 mRNA upstream 689186 14233553 ~ 14274803 (-) True XLOC_013295
TCONS_00026300 mRNA upstream 789756 14334123 ~ 14337450 (-) False XLOC_013296
TCONS_00026301 mRNA upstream 789891 14334258 ~ 14337065 (-) False XLOC_013296
TCONS_00026303 mRNA upstream 1127422 14671789 ~ 14677936 (-) True XLOC_013297
TCONS_00026304 mRNA upstream 1144276 14688643 ~ 14691727 (-) True XLOC_013298
TCONS_00026297 other downstream 66028 13477102 ~ 13478222 (-) True XLOC_013293
TCONS_00026288 other downstream 598519 12945617 ~ 12945731 (-) True XLOC_013286
TCONS_00026284 other downstream 778798 12761610 ~ 12765452 (-) True XLOC_013282
TCONS_00026283 other downstream 781558 12760802 ~ 12762692 (-) False XLOC_013282
TCONS_00026282 other downstream 1012090 12532046 ~ 12532160 (-) True XLOC_013281
TCONS_00026302 other upstream 792260 14336627 ~ 14337458 (-) True XLOC_013296
TCONS_00026312 other upstream 1322016 14866383 ~ 14871136 (-) True XLOC_013303
TCONS_00026322 other upstream 1491784 15036151 ~ 15036269 (-) True XLOC_013308
TCONS_00026338 other upstream 2034135 15578502 ~ 15610237 (-) True XLOC_013318
TCONS_00026339 other upstream 2043720 15588087 ~ 15588201 (-) True XLOC_013319