RNA id: TCONS_00026444


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00026444
length 98
RNA type snoRNA
GC content 0.47
exon number 1
gene id XLOC_013381
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 19455144 ~ 19455241 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGCTATGATGGTGTAATTTGCGTCCTACTCTGTGTTCAGTGACAGTTGCCTGCTGTCTCATGCTGGCACAGAAGGTTGATGACAACAAAGTCTGAGCA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000116723

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00026439 lncRNA downstream 1405 19452614 ~ 19453739 (-) False XLOC_013375
TCONS_00027292 lncRNA downstream 343228 19110047 ~ 19111916 (-) True XLOC_013371
TCONS_00026960 lncRNA downstream 576420 18876390 ~ 18878724 (-) True XLOC_013366
TCONS_00027291 lncRNA downstream 633774 18815654 ~ 18821370 (-) False XLOC_013359
TCONS_00027290 lncRNA downstream 661879 18787384 ~ 18793265 (-) False XLOC_013363
TCONS_00027293 lncRNA upstream 428350 19883591 ~ 19884294 (-) True XLOC_013386
TCONS_00027294 lncRNA upstream 684831 20140072 ~ 20149097 (-) True XLOC_013387
TCONS_00027295 lncRNA upstream 830424 20285665 ~ 20319873 (-) False XLOC_013388
TCONS_00026961 lncRNA upstream 850243 20305484 ~ 20319795 (-) True XLOC_013388
TCONS_00026461 lncRNA upstream 1142823 20598064 ~ 20608237 (-) False XLOC_013393
TCONS_00026432 mRNA downstream 49528 19143437 ~ 19405616 (-) False XLOC_013372
TCONS_00026431 mRNA downstream 49528 19143437 ~ 19405616 (-) True XLOC_013372
TCONS_00026430 mRNA downstream 104352 19143437 ~ 19350792 (-) False XLOC_013372
TCONS_00026428 mRNA downstream 351215 19045126 ~ 19103929 (-) False XLOC_013370
TCONS_00026446 mRNA upstream 8184 19463425 ~ 19484919 (-) False XLOC_013382
TCONS_00026445 mRNA upstream 8184 19463425 ~ 19484919 (-) True XLOC_013382
TCONS_00026447 mRNA upstream 32461 19487702 ~ 19491162 (-) True XLOC_013383
TCONS_00026449 mRNA upstream 357367 19812608 ~ 19819812 (-) True XLOC_013385
TCONS_00026450 mRNA upstream 980580 20435821 ~ 20458840 (-) False XLOC_013389
TCONS_00026443 other downstream 277 19454800 ~ 19454867 (-) True XLOC_013380
TCONS_00026442 other downstream 561 19454486 ~ 19454583 (-) True XLOC_013375
TCONS_00026440 other downstream 2263 19452751 ~ 19452881 (-) True XLOC_013379
TCONS_00026438 other downstream 2866 19452210 ~ 19452278 (-) True XLOC_013378
TCONS_00026437 other downstream 3207 19451870 ~ 19451937 (-) True XLOC_013377
TCONS_00026448 other upstream 86861 19542102 ~ 19542231 (-) True XLOC_013384
TCONS_00026456 other upstream 1086609 20541850 ~ 20559990 (-) False XLOC_013392
TCONS_00026460 other upstream 1129849 20585090 ~ 20594242 (-) False XLOC_013393
TCONS_00026464 other upstream 1178548 20633789 ~ 20633923 (-) True XLOC_013395
TCONS_00026468 other upstream 1390949 20846190 ~ 20846313 (-) True XLOC_013398

Expression Profile

//