RNA id: TCONS_00026464


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00026464
length 135
RNA type rRNA
GC content 0.41
exon number 1
gene id XLOC_013395
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 20633789 ~ 20633923 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TCTATAtaaaattctgtaaatacatatacagcaagttaacttgtgctgtaaatgtaaacactgaagctaagcagggctgtgctcggtcagtacctggatgggagaccacatgggaaagctatgtTTCTGCCAGAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000119373

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00026461 lncRNA downstream 25552 20598064 ~ 20608237 (-) False XLOC_013393
TCONS_00027295 lncRNA downstream 313916 20285665 ~ 20319873 (-) False XLOC_013388
TCONS_00026961 lncRNA downstream 313994 20305484 ~ 20319795 (-) True XLOC_013388
TCONS_00027294 lncRNA downstream 484692 20140072 ~ 20149097 (-) True XLOC_013387
TCONS_00027293 lncRNA downstream 749495 19883591 ~ 19884294 (-) True XLOC_013386
TCONS_00026963 lncRNA upstream 530903 21164826 ~ 21168118 (-) False XLOC_013403
TCONS_00026962 lncRNA upstream 530903 21164826 ~ 21168118 (-) True XLOC_013403
TCONS_00026498 lncRNA upstream 1298330 21932253 ~ 21936575 (-) False XLOC_013415
TCONS_00026499 lncRNA upstream 1310282 21944205 ~ 21947172 (-) True XLOC_013415
TCONS_00027296 lncRNA upstream 1916672 22550595 ~ 22552314 (-) True XLOC_013420
TCONS_00026458 mRNA downstream 25489 20581685 ~ 20608300 (-) False XLOC_013393
TCONS_00026459 mRNA downstream 25764 20583930 ~ 20608025 (-) False XLOC_013393
TCONS_00026462 mRNA downstream 25764 20598443 ~ 20608025 (-) True XLOC_013393
TCONS_00026457 mRNA downstream 73730 20543177 ~ 20560059 (-) True XLOC_013392
TCONS_00026455 mRNA downstream 73782 20541316 ~ 20560007 (-) False XLOC_013392
TCONS_00026465 mRNA upstream 8455 20642378 ~ 20674121 (-) True XLOC_013396
TCONS_00026466 mRNA upstream 92226 20726149 ~ 20822045 (-) False XLOC_013397
TCONS_00026467 mRNA upstream 96130 20730053 ~ 20816103 (-) True XLOC_013397
TCONS_00026469 mRNA upstream 225738 20859661 ~ 20869175 (-) True XLOC_013399
TCONS_00026470 mRNA upstream 247539 20881462 ~ 21047580 (-) False XLOC_013400
TCONS_00026460 other downstream 39547 20585090 ~ 20594242 (-) False XLOC_013393
TCONS_00026456 other downstream 73799 20541850 ~ 20559990 (-) False XLOC_013392
TCONS_00026448 other downstream 1091558 19542102 ~ 19542231 (-) True XLOC_013384
TCONS_00026444 other downstream 1178548 19455144 ~ 19455241 (-) True XLOC_013381
TCONS_00026443 other downstream 1178922 19454800 ~ 19454867 (-) True XLOC_013380
TCONS_00026468 other upstream 212267 20846190 ~ 20846313 (-) True XLOC_013398
TCONS_00026472 other upstream 386988 21020911 ~ 21024571 (-) True XLOC_013400
TCONS_00026485 other upstream 1078373 21712296 ~ 21720051 (-) True XLOC_013411
TCONS_00026501 other upstream 1449849 22083772 ~ 22083886 (-) True XLOC_013417
TCONS_00026504 other upstream 1916672 22550595 ~ 22552256 (-) False XLOC_013420