RNA id: TCONS_00026526


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00026526
length 119
RNA type rRNA
GC content 0.47
exon number 1
gene id XLOC_013436
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 24316181 ~ 24316299 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TTATATGGCCACatttcaccctgcagcccaaggctggttactcactgaagctaagcagtgcTGAGCCttgtcagtacctgaatgggagatcACATGGATATACCAGATTGCtgttagaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000119399

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00027318 lncRNA downstream 232345 24047486 ~ 24083836 (-) True XLOC_013434
TCONS_00027317 lncRNA downstream 236937 24047486 ~ 24079244 (-) False XLOC_013434
TCONS_00027316 lncRNA downstream 292920 23933175 ~ 24023261 (-) True XLOC_013432
TCONS_00027314 lncRNA downstream 431527 23877479 ~ 23884654 (-) False XLOC_013433
TCONS_00027319 lncRNA upstream 25306 24341605 ~ 24476885 (-) False XLOC_013435
TCONS_00027320 lncRNA upstream 34271 24350570 ~ 24476885 (-) False XLOC_013435
TCONS_00027321 lncRNA upstream 34271 24350570 ~ 24476890 (-) False XLOC_013435
TCONS_00027323 lncRNA upstream 34271 24350570 ~ 24476910 (-) False XLOC_013435
TCONS_00027322 lncRNA upstream 34271 24350570 ~ 24476910 (-) False XLOC_013435
TCONS_00026521 mRNA downstream 440811 23868650 ~ 23875370 (-) False XLOC_013432
TCONS_00026522 mRNA downstream 440962 23870402 ~ 23875219 (-) False XLOC_013432
TCONS_00026524 mRNA downstream 441252 23873455 ~ 23874929 (-) False XLOC_013432
TCONS_00026514 mRNA downstream 1562544 22739732 ~ 22753637 (-) False XLOC_013426
TCONS_00026515 mRNA downstream 1562544 22746506 ~ 22753637 (-) True XLOC_013426
TCONS_00026532 mRNA upstream 617174 24933473 ~ 24989580 (-) False XLOC_013440
TCONS_00026533 mRNA upstream 622393 24938692 ~ 24988661 (-) False XLOC_013440
TCONS_00026534 mRNA upstream 664585 24980884 ~ 24988645 (-) True XLOC_013440
TCONS_00026538 mRNA upstream 679720 24996019 ~ 24996634 (-) True XLOC_013441
TCONS_00026539 mRNA upstream 711196 25027495 ~ 25051846 (-) True XLOC_013442
TCONS_00026523 other downstream 293168 23873344 ~ 24023013 (-) False XLOC_013432
TCONS_00026516 other downstream 1453714 22859479 ~ 22862467 (-) True XLOC_013427
TCONS_00026513 other downstream 1572815 22739732 ~ 22743366 (-) False XLOC_013426
TCONS_00026504 other downstream 1763925 22550595 ~ 22552256 (-) False XLOC_013420
TCONS_00026501 other downstream 2232295 22083772 ~ 22083886 (-) True XLOC_013417
TCONS_00026527 other upstream 71720 24388019 ~ 24476883 (-) False XLOC_013435
TCONS_00026529 other upstream 243888 24560187 ~ 24560397 (-) True XLOC_013437
TCONS_00026536 other upstream 673969 24990268 ~ 24996647 (-) False XLOC_013441
TCONS_00026541 other upstream 842362 25158661 ~ 25158777 (-) True XLOC_013444
TCONS_00026548 other upstream 1199594 25515893 ~ 25516631 (-) True XLOC_013448