RNA id: TCONS_00026630


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00026630
length 5462
RNA type mRNA
GC content 0.36
exon number 4
gene id XLOC_013515
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 33074718 ~ 33080454 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ATGGCCTTCATGTCACACAGAGAGATCAAATTATTAGTAGATGAGCTCTACAAGCAGAATGTCACAGGACTGCAGTGGATTGGCAGTGATGCCTGGATCACAGATGACTCTCTAGCAGATAtctatggtcacactttacttaCTGGCTCTATTGGATTTGCTGTCCGCAATGCTCAAATACCTGGACTGGGCTCTTTTCTACAGAAAGTTAATCCCTCTCAATTTCCTAACAGCATATTTGTTAAAGATTTTTGGGAGCATGTCTTTGACTGTTCATTCACTACTAGTAAATTAACAAAAAGGTGTAATGGATCTGAAAACTTAAGTGATGTGCAAAACTCTTTTACAGATTTGACTGACTTAAGGTtctcaaacaatatatataaagcTGTTTATGCGGTAGCTCATGCAATTAATAATCTACTCTTATGTGAGGAAAATAAAAGCTCCAGTCCTAACGCCTGTCTGAAACTTGCAGAAATAAAGCCTTGGCAGCTTTTAAACTCCTTGCAAAGTGTAAATTTCACAACACCTGGGGGAGAAAGTGTCTTCTTTGATAGCAACGGGGATTCACCAGCAAGATATGAGCTGATCAATCTTCAAAGTGTTGACAGAGGCAAAATAGATGTGGAAACTATTGGCTACTATGATGCCTCTCTGCCTAAAGATCAACGGTTCTCCATGAATAATGTTAAGGTAGTCTGGAGAGAAGGGGGAGATCAGGTGCCTGTATCTGTGTGCAGTACAAGCTGTCCCTCAGGCACCAGGAAAGCAATGCAGAAAGGAAGACCGGTCTGTTGTTATGACTGTATACTGTGCCCACCAGGAGAGATTAGTAACAAAACTGATTCAGTTGATTGCCTTAAATGCCCTGTTACACAGTGGTCAAATACAAGAGGAGATGCCTGTATCCCAAAAGAAATTGAATTTTTGTCATATGATGAAATAATGGGAATACTTTTGGGATTGTTTTCTTTAATTGGGGCATTTTTTACTATAGTAGTCACACTTATTTTCTATATTTACAGAAGCACACCTATAGTAAGAGCTAACAATTCAGAACTGAGTTTCCTACTGCTCTTCTCACTGACTCTGTGTTTCCTCTGTTCACTCACTTTCATTGGTCGTCCCACTGAGTGGTCGTGTATGTTGCGACACACAGCGTTTGGGATCACTTTTGTCCTCTGTATCTCATGTGTTCTGGGGAAAACATTAGTGGTGTTAATGGCCTTCAAAGCTACACTTCCAGGAAGTAATGTCATGAAATGGTTTGGGCCTCTTCAACAAAGACTCAGTGTTGTTAGCTTTACTTTTATACAGCTCCTTATATGTGCACTTTGGTTAATATTATCACCACCATTTCCATATATGAACATGAAGCATTACCAAGAAAAAGTTATTTTAGAATGCAATGTAGGTTCAGCTACTGGTTTCTGGGCTGTACTGGGTTATATTGGTCTCCTGGCTgtcctttgctttgttttggcttTTCTCGGAAGGAAACTACCTGACAATTTCAATGAGGCTAAATTCATCACATTCAGTATGCTCATATTTTGTGCTGTATGGATCACATTTATCCCAGCTTATATCAGCTCTCCTGGAAAGTTTATCGTAGCTGTGGAGATATTTGCTATTTTGGTGTCATCCTTTGGATTACTTTTCTGTATTTTCTTGCCAAAGTGCTATGTAATTTTACTGAGACCAGAAATTAACACTAAAAAGCATGTCATGGCGAAGATAAATAAATAGTCATTAATATAAACTGTACTTGCTAAAATAATACATTGCAATTTGTATATTATAAAAGGAAAATAACTGAGATATAAACATGTTTTGTGCTATAGATAAATTCATTGTCAGACATTACACTACAATAAATATACCTGTAAGAAAAGTTGTGTTTTTTAGCATAGAGCTAAAAAGCTGTTAATTATCATAGAGCAGATTTGAGATTTACCAGACATTTATGTTACATTTTCATAGTCACAAAACACTTCTAATACAATAACGccaaagaagaaaaataattatagactcaattattataaaacattataaaaagaaaaaaaatatttttaacatagCAAATTGCACCATTGTAACACTGATAGAAAAAGAAATTTAAGTCTTATagagctttaaaaaatatatatatatatatacatacacacaaacacacacctagtTCTTCAATTTTATGAATCTTGCTTATATATATTGCCATTTTTGATTcacctataataataaaaaaattgcgtATAATGATACCCAACAATGCCCAATAAAACTCTCAACCATAAAGATTATATTAAACTTACTgaacaaaaaagataaaaatcaaataattgaCAGTCTCATACCCtacataaaactatttttttttccacaaacagGACATAAACTGCATACATTTGGGTTAATCACAGAATAAACAGCAACTGTACCATGTAAAATTCACTTTTAGAGATCGCCCTTTTTTTCCAATGGAAGTTTATAAAAACTCTCCATACAGGTTGTATGTCCTGATCCAACCCTTATAGAgaggaggaactatgacgtcactttgtaggctaatcggctgctagcataaaactggttccctcgtgaaaatccctttcaaatttcccataggcttttcgaagattgcaaataataagctctgtgttcaaacactgttcattacacttacatgttttgtccagccggataatcctcacacgaaaatacaactttgagcacttttggatcttaaatgcaaacgcaagatttgaaaagctaacattaggctataaatggACTACACTGCCCTCAGGGCGCCcgcctgtgacgtcagccccaccctgctacagacgacttgtcaagcttatttttagaaataatatccCTGACAAAGagtctctgtttattatattataatccacgctatatattataaacaaataaatacgcaaaaacactTACACCTACGTGCCTTTTGGACCGTTTTTACGTggtaaatacatctgttttgctttgcggttgttctaaaagttttaaaactgcgtgtataaatctgcctacatTGTATTAtcatcagacatatttaaataagtgtatcgcgcGCGTGCACACAGCTTGCTTAtcttaacagacgacagaaatgaggcgtgaggaggaacaagtctatcaaatgcctgcaagttccatcatcatggacacagagcaacatatttaatattccttttatgtcacgacgtacagcgaaaagcagcccaatacagtcacatctgctatacgttttatgaaggagtgtaaatattgcagttatgacagagtaaaatgtgttcagatgaagaaaaaaagacgagaaatcactagatcacgttaaaatgacagtcaacaacttgatagcaaccttctttttaaagaagcatggcCGAATTAAAAATTGAAGAgggtgctgtaactgatgtgttttatgtcatagaacaaaacgtgaaagtatgtTGAATTTGTGttagccacggaccttatttaagcgattttactgaaccccatacaaaaaacccattgactttgggacgagggaaccggaagtgctaaaatgctgaCTCGCtcccgggtttttgcatacaaattgatgtcatagttcctccacacTATTGGTCTCTTCAAACAGTGTCAACTgttcatttcaattttttttcttgcatttaaaacgtttgtaaaaaatgttttactaatAGCCATATTACTTGTAGAGTTAATTACTTTAGGAATGTGGTCTTTGTTGTTGGGAACTAatcaataaatcattatttttttcttaaaaatgctACATATTCTTAAGACCCCTTTATATAAAGTAGTCTATTTAGTTTAATGTTCCTAAAGTCAAACAAATGTCTTAGCCCAGGTCAGCAGTTTGTCTCTAAACAAAGCTAGCAACATGTCATTAATTATCATGCACTATTTAATACTCATCACTGTCAACTGTATTCTTCGACAAATTCAATGGTTTCTATTCATTAACAAAACTCTTATTGGAAAAACTCCACTATGTTTGCAGTCACTTCTTATCATTCAGGAAACACGTCGAAATCTGTGCTCTAGTAATTTCATTAACCTTTGCATACCCAAAGTTCACACTTGATTTGGTCACCactcttttcagttttctgctgctgatgcttggAATCATCTGCAGCAGACCTTAAAGCTCAAGCCTTTCATTTCACTATCATCTTGTAAAAAATTCAATTCAGtcaatagttcattcattcagtcattttcttgtcggcttagtccttttattaatccggggttgccacagcagaatgaaccgccaacttatccagcaagtttttacgaagcggatgcccttccaggcgcaacccatctctgggaaacattcacacacacactcatacactacagacaatttagcctacacaattcacctgtaccacatgtctttggactgtgggggaaaccggagcacctggaggaaactcacacaaaggcagggagaacatgcaaactccacacagaaacgccaactaagccgaggttcaaaccagcgaccttcttgctgtgagatgacagctcTACCTACCGCGCCACTACCTCGCCCGTCAATAGTTCATGATcactgtaattgtttttagttttttgttggtTTCATATGTTATTGTCTGCATTTGTgaaattgttatattatataagttatagttattaataaaataaataaagttatatatattaataaaacttatgcaatctgcatccccgaaatgaaagtacaaagactgccacctggtggtgcaaagaaaaaactttttttatatgaactttttagattgctttagtacaatttgtgtatgataatagaaatgcagaatatgtgactttttaaaaaaataaataatacattaatgcagtcataaacatgtgttggcagttaatatgccagtgattatgcttcacaaaagttgcattatgcctttaccaatatcaaa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Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000191907

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00026629 lncRNA downstream 27274 33043295 ~ 33047444 (-) True XLOC_013514
TCONS_00026977 lncRNA downstream 30442 33042762 ~ 33044276 (-) False XLOC_013514
TCONS_00026976 lncRNA downstream 34861 33037834 ~ 33039857 (-) True XLOC_013513
TCONS_00027365 lncRNA downstream 174720 32896565 ~ 32899998 (-) True XLOC_013512
TCONS_00027364 lncRNA downstream 259364 32808945 ~ 32815354 (-) True XLOC_013511
TCONS_00026637 lncRNA upstream 633903 33714357 ~ 33723946 (-) False XLOC_013520
TCONS_00027366 lncRNA upstream 633903 33714357 ~ 33735250 (-) True XLOC_013520
TCONS_00027367 lncRNA upstream 702010 33782464 ~ 33796612 (-) True XLOC_013521
TCONS_00026978 lncRNA upstream 865888 33946342 ~ 33949859 (-) True XLOC_013522
TCONS_00027368 lncRNA upstream 1041742 34122196 ~ 34142630 (-) True XLOC_013524
TCONS_00026627 mRNA downstream 365390 32674236 ~ 32709328 (-) False XLOC_013510
TCONS_00026628 mRNA downstream 365421 32705465 ~ 32709297 (-) True XLOC_013510
TCONS_00026626 mRNA downstream 396963 32674212 ~ 32677755 (-) False XLOC_013510
TCONS_00026623 mRNA downstream 934824 32135370 ~ 32139894 (-) True XLOC_013506
TCONS_00026618 mRNA downstream 1104779 31965347 ~ 31969939 (-) True XLOC_013503
TCONS_00026631 mRNA upstream 389 33080843 ~ 33085006 (-) True XLOC_013516
TCONS_00026633 mRNA upstream 10029 33090483 ~ 33093705 (-) True XLOC_013517
TCONS_00026634 mRNA upstream 168542 33248996 ~ 33254039 (-) False XLOC_013518
TCONS_00026635 mRNA upstream 169870 33250324 ~ 33252983 (-) True XLOC_013518
TCONS_00026636 mRNA upstream 252957 33333411 ~ 33337703 (-) True XLOC_013519
TCONS_00026625 other downstream 547614 32525411 ~ 32527104 (-) True XLOC_013509
TCONS_00026611 other downstream 2219183 30854496 ~ 30855535 (-) True XLOC_013494
TCONS_00026599 other downstream 3155613 29918062 ~ 29919105 (-) True XLOC_013487
TCONS_00026598 other downstream 3176357 29895611 ~ 29898361 (-) True XLOC_013486
TCONS_00026594 other downstream 3767077 29307525 ~ 29307641 (-) True XLOC_013484
TCONS_00026632 other upstream 9989 33090443 ~ 33093741 (-) False XLOC_013517
TCONS_00026656 other upstream 2492727 35573181 ~ 35573295 (-) True XLOC_013536
TCONS_00026662 other upstream 3374853 36455307 ~ 36465466 (-) True XLOC_013541
TCONS_00026673 other upstream 4329369 37409823 ~ 37415353 (-) False XLOC_013550
TCONS_00026691 other upstream 6105720 39186174 ~ 39188401 (-) True XLOC_013560

Expression Profile

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