RNA id: TCONS_00026656


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00026656
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.54
exon number 1
gene id XLOC_013536
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 35573181 ~ 35573295 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GCCAGCAGCTAgttctctgcaactcttacatggttgcccactgaagctaagcagggctgtgcccagtcagtatctggatgggagatcacatgggaaagccaggttgctgctggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000184756

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00026983 lncRNA downstream 7785 35561269 ~ 35565396 (-) False XLOC_013535
TCONS_00026984 lncRNA downstream 7896 35562009 ~ 35565285 (-) True XLOC_013535
TCONS_00026982 lncRNA downstream 25123 35544276 ~ 35548058 (-) False XLOC_013535
TCONS_00027372 lncRNA downstream 319159 35251298 ~ 35254022 (-) True XLOC_013531
TCONS_00026981 lncRNA downstream 685109 34886240 ~ 34888072 (-) True XLOC_013530
TCONS_00027373 lncRNA upstream 1141344 36714639 ~ 36733902 (-) True XLOC_013542
TCONS_00027374 lncRNA upstream 1275854 36849149 ~ 36887252 (-) False XLOC_013543
TCONS_00027375 lncRNA upstream 1295656 36868951 ~ 36874790 (-) False XLOC_013543
TCONS_00027376 lncRNA upstream 1295656 36868951 ~ 36874818 (-) False XLOC_013543
TCONS_00026663 lncRNA upstream 1295656 36868951 ~ 36886706 (-) False XLOC_013543
TCONS_00026653 mRNA downstream 113185 35429333 ~ 35459996 (-) False XLOC_013534
TCONS_00026654 mRNA downstream 113576 35435226 ~ 35459605 (-) True XLOC_013534
TCONS_00026652 mRNA downstream 165391 35405090 ~ 35407790 (-) True XLOC_013533
TCONS_00026650 mRNA downstream 165486 35403045 ~ 35407695 (-) False XLOC_013533
TCONS_00026651 mRNA downstream 165651 35405090 ~ 35407530 (-) False XLOC_013533
TCONS_00026657 mRNA upstream 234293 35807588 ~ 35837673 (-) True XLOC_013537
TCONS_00026658 mRNA upstream 265457 35838752 ~ 35842554 (-) True XLOC_013538
TCONS_00026659 mRNA upstream 487000 36060295 ~ 36066087 (-) False XLOC_013539
TCONS_00026660 mRNA upstream 489710 36063005 ~ 36066087 (-) True XLOC_013539
TCONS_00026661 mRNA upstream 532635 36105930 ~ 36135799 (-) True XLOC_013540
TCONS_00026632 other downstream 2479440 33090443 ~ 33093741 (-) False XLOC_013517
TCONS_00026625 other downstream 3046077 32525411 ~ 32527104 (-) True XLOC_013509
TCONS_00026611 other downstream 4717646 30854496 ~ 30855535 (-) True XLOC_013494
TCONS_00026599 other downstream 5654076 29918062 ~ 29919105 (-) True XLOC_013487
TCONS_00026598 other downstream 5674820 29895611 ~ 29898361 (-) True XLOC_013486
TCONS_00026662 other upstream 882012 36455307 ~ 36465466 (-) True XLOC_013541
TCONS_00026673 other upstream 1836528 37409823 ~ 37415353 (-) False XLOC_013550
TCONS_00026691 other upstream 3612879 39186174 ~ 39188401 (-) True XLOC_013560
TCONS_00026695 other upstream 4013251 39586546 ~ 39586665 (-) True XLOC_013565
TCONS_00026696 other upstream 4042480 39615775 ~ 39615905 (-) True XLOC_013566