RNA id: TCONS_00028062



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00028062
length 121
RNA type rRNA
GC content 0.54
exon number 1
gene id XLOC_014081
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 25175272 ~ 25175392 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GGCCACAGTCTTATAACCCCACAGCCCAAGACCAGTTTctcactgaagttaagcagggctgagcctggtcagtacctggatgggagaccacatgctgttggaagtggtgttagtgaggcca

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000168730

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00028060 lncRNA upstream 22695 25151416 ~ 25152577 (+) True XLOC_014079
TCONS_00029915 lncRNA upstream 114305 25003517 ~ 25060967 (+) True XLOC_014078
TCONS_00029914 lncRNA upstream 191764 24959229 ~ 24983508 (+) True XLOC_014077
TCONS_00028059 lncRNA upstream 239977 24922531 ~ 24935295 (+) True XLOC_014076
TCONS_00028055 lncRNA upstream 289327 24885116 ~ 24885945 (+) True XLOC_014074
TCONS_00029916 lncRNA downstream 1858481 27033873 ~ 27041528 (+) True XLOC_014097
TCONS_00028095 lncRNA downstream 2178953 27354345 ~ 27354866 (+) True XLOC_014098
TCONS_00028103 lncRNA downstream 2711926 27887318 ~ 27892055 (+) True XLOC_014102
TCONS_00029917 lncRNA downstream 2799273 27974665 ~ 27976483 (+) True XLOC_014104
TCONS_00029918 lncRNA downstream 2939122 28114514 ~ 28187683 (+) False XLOC_014105
TCONS_00028061 mRNA upstream 20014 25154066 ~ 25155258 (+) True XLOC_014080
TCONS_00028058 mRNA upstream 258064 24896409 ~ 24917208 (+) True XLOC_014075
TCONS_00028056 mRNA upstream 259752 24891747 ~ 24915520 (+) False XLOC_014075
TCONS_00028057 mRNA upstream 259756 24891766 ~ 24915516 (+) False XLOC_014075
TCONS_00028054 mRNA upstream 286045 24882845 ~ 24889227 (+) False XLOC_014074
TCONS_00028063 mRNA downstream 289633 25465025 ~ 25467185 (+) True XLOC_014082
TCONS_00028064 mRNA downstream 300836 25476228 ~ 25512695 (+) False XLOC_014083
TCONS_00028065 mRNA downstream 302811 25478203 ~ 25492470 (+) False XLOC_014083
TCONS_00028066 mRNA downstream 322149 25497541 ~ 25504499 (+) False XLOC_014083
TCONS_00028067 mRNA downstream 329253 25504645 ~ 25506314 (+) False XLOC_014083
TCONS_00028035 other upstream 1261972 23913182 ~ 23913300 (+) True XLOC_014055
TCONS_00028032 other upstream 1520558 23652399 ~ 23654714 (+) False XLOC_014053
TCONS_00028033 other upstream 1520558 23652781 ~ 23654714 (+) False XLOC_014053
TCONS_00028034 other upstream 1520558 23653700 ~ 23654714 (+) True XLOC_014053
TCONS_00028031 other upstream 1533941 23637789 ~ 23641331 (+) True XLOC_014052
TCONS_00028068 other downstream 333401 25508793 ~ 25511562 (+) True XLOC_014083
TCONS_00028073 other downstream 1017430 26192822 ~ 26192936 (+) True XLOC_014087
TCONS_00028077 other downstream 1401202 26576594 ~ 26576708 (+) True XLOC_014090
TCONS_00028082 other downstream 1630374 26805766 ~ 26805882 (+) True XLOC_014093
TCONS_00028091 other downstream 1753232 26928624 ~ 26931433 (+) True XLOC_014095