RNA id: TCONS_00028122


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00028122
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_014111
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 29203142 ~ 29203257 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

gccggCAGCTAGCATTCTGCAACTCTCTTATGGCCGCCCTACTGAAACTAAGCAGAGATGCAGCcagttagtacctggatgggagaccacataagaaagctagattgctgctggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000176457

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00029722 lncRNA upstream 95448 29105935 ~ 29107694 (+) True XLOC_014110
TCONS_00028119 lncRNA upstream 378752 28788968 ~ 28824390 (+) False XLOC_014109
TCONS_00029923 lncRNA upstream 378752 28790710 ~ 28824390 (+) False XLOC_014109
TCONS_00029925 lncRNA upstream 378752 28790710 ~ 28824390 (+) False XLOC_014109
TCONS_00029927 lncRNA upstream 378752 28790710 ~ 28824390 (+) False XLOC_014109
TCONS_00029944 lncRNA downstream 255860 29459117 ~ 29489898 (+) False XLOC_014114
TCONS_00029946 lncRNA downstream 255860 29459117 ~ 29586042 (+) False XLOC_014114
TCONS_00029945 lncRNA downstream 255860 29459117 ~ 29586042 (+) False XLOC_014114
TCONS_00029947 lncRNA downstream 255860 29459117 ~ 29586739 (+) False XLOC_014114
TCONS_00029948 lncRNA downstream 255860 29459117 ~ 29601454 (+) False XLOC_014114
TCONS_00028116 mRNA upstream 868987 28291440 ~ 28334155 (+) False XLOC_014108
TCONS_00028113 mRNA upstream 869302 28291062 ~ 28333840 (+) False XLOC_014108
TCONS_00028115 mRNA upstream 883003 28291376 ~ 28320139 (+) False XLOC_014108
TCONS_00028112 mRNA upstream 912929 28284120 ~ 28290213 (+) True XLOC_014107
TCONS_00028108 mRNA upstream 940245 28116410 ~ 28262897 (+) False XLOC_014105
TCONS_00028124 mRNA downstream 100590 29303847 ~ 29333867 (+) True XLOC_014112
TCONS_00028125 mRNA downstream 134532 29337789 ~ 29363779 (+) True XLOC_014113
TCONS_00028126 mRNA downstream 594807 29798064 ~ 29800205 (+) False XLOC_014116
TCONS_00028127 mRNA downstream 594849 29798106 ~ 29800812 (+) True XLOC_014116
TCONS_00028128 mRNA downstream 605214 29808471 ~ 29821601 (+) False XLOC_014117
TCONS_00028118 other upstream 868978 28331227 ~ 28334164 (+) True XLOC_014108
TCONS_00028117 other upstream 872045 28321679 ~ 28331097 (+) False XLOC_014108
TCONS_00028114 other upstream 887189 28291376 ~ 28315953 (+) False XLOC_014108
TCONS_00028109 other upstream 1059888 28143135 ~ 28143254 (+) True XLOC_014106
TCONS_00028091 other upstream 2271709 26928624 ~ 26931433 (+) True XLOC_014095
TCONS_00028123 other downstream 100590 29303847 ~ 29320883 (+) False XLOC_014112
TCONS_00028134 other downstream 650992 29854249 ~ 29860206 (+) False XLOC_014118
TCONS_00028136 other downstream 655779 29859036 ~ 29860334 (+) True XLOC_014118
TCONS_00028142 other downstream 1315198 30518455 ~ 30518573 (+) True XLOC_014123
TCONS_00028145 other downstream 1427686 30630943 ~ 30631060 (+) True XLOC_014125