RNA id: TCONS_00028141


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00028141
length 171
RNA type mRNA
GC content 0.41
exon number 9
gene id XLOC_014122
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 30495109 ~ 30516680 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GATGGAGGGAGTGGCTCCAGACACTCCTCCGCCAGCTCCTGCAGCTCCTCCCAGAAtcataacaatttgcttttggttggagtattttcttTACCTAacaagctggtctctccacatcagataaaaacaaaagtcttgtcacttaacagaaataataatatctattatatg

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000192229

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00029954 lncRNA upstream 679377 29808713 ~ 29815732 (+) False XLOC_014117
TCONS_00028132 lncRNA upstream 679377 29814782 ~ 29815732 (+) True XLOC_014117
TCONS_00028130 lncRNA upstream 680271 29808713 ~ 29814838 (+) False XLOC_014117
TCONS_00029952 lncRNA upstream 743366 29746138 ~ 29751743 (+) False XLOC_014115
TCONS_00028144 lncRNA downstream 71186 30587866 ~ 30589951 (+) False XLOC_014124
TCONS_00028143 lncRNA downstream 71186 30587866 ~ 30589951 (+) True XLOC_014124
TCONS_00029723 lncRNA downstream 208316 30724996 ~ 30725703 (+) True XLOC_014127
TCONS_00029955 lncRNA downstream 283372 30800052 ~ 30801988 (+) True XLOC_014128
TCONS_00029956 lncRNA downstream 315610 30832290 ~ 30836205 (+) True XLOC_014129
TCONS_00028140 mRNA upstream 26875 30450125 ~ 30468234 (+) True XLOC_014121
TCONS_00028139 mRNA upstream 66208 30423117 ~ 30428901 (+) True XLOC_014120
TCONS_00028138 mRNA upstream 95233 30388186 ~ 30399876 (+) True XLOC_014119
TCONS_00028137 mRNA upstream 95931 30387999 ~ 30399178 (+) False XLOC_014119
TCONS_00028133 mRNA upstream 634891 29854223 ~ 29860218 (+) False XLOC_014118
TCONS_00028146 mRNA downstream 116773 30633453 ~ 30683678 (+) False XLOC_014126
TCONS_00028147 mRNA downstream 145849 30662529 ~ 30684874 (+) True XLOC_014126
TCONS_00028148 mRNA downstream 351165 30867845 ~ 30884054 (+) False XLOC_014131
TCONS_00028150 mRNA downstream 368026 30884706 ~ 30895272 (+) False XLOC_014132
TCONS_00028151 mRNA downstream 368280 30884960 ~ 30891182 (+) False XLOC_014132
TCONS_00028136 other upstream 634775 29859036 ~ 29860334 (+) True XLOC_014118
TCONS_00028134 other upstream 634903 29854249 ~ 29860206 (+) False XLOC_014118
TCONS_00028123 other upstream 1174226 29303847 ~ 29320883 (+) False XLOC_014112
TCONS_00028122 other upstream 1291852 29203142 ~ 29203257 (+) True XLOC_014111
TCONS_00028118 other upstream 2160945 28331227 ~ 28334164 (+) True XLOC_014108
TCONS_00028142 other downstream 1775 30518455 ~ 30518573 (+) True XLOC_014123
TCONS_00028145 other downstream 114263 30630943 ~ 30631060 (+) True XLOC_014125
TCONS_00028149 other downstream 363108 30879788 ~ 30882456 (+) True XLOC_014131
TCONS_00028153 other downstream 368304 30884984 ~ 30887251 (+) False XLOC_014132
TCONS_00028157 other downstream 368632 30885312 ~ 30891010 (+) True XLOC_014132