RNA id: TCONS_00028142



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00028142
length 119
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_014123
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 30518455 ~ 30518573 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ggtggcagtcatatcaccctgcagctcaagaTCGGTTACTCGCTGAAGCTAATCAGGGCTGAGCCtatggtcagtacctggatgggagaccacatgggaaaactaggtttctGTTGGAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000115747

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00029954 lncRNA upstream 702723 29808713 ~ 29815732 (+) False XLOC_014117
TCONS_00028132 lncRNA upstream 702723 29814782 ~ 29815732 (+) True XLOC_014117
TCONS_00028130 lncRNA upstream 703617 29808713 ~ 29814838 (+) False XLOC_014117
TCONS_00029952 lncRNA upstream 766712 29746138 ~ 29751743 (+) False XLOC_014115
TCONS_00028144 lncRNA downstream 69293 30587866 ~ 30589951 (+) False XLOC_014124
TCONS_00028143 lncRNA downstream 69293 30587866 ~ 30589951 (+) True XLOC_014124
TCONS_00029723 lncRNA downstream 206423 30724996 ~ 30725703 (+) True XLOC_014127
TCONS_00029955 lncRNA downstream 281479 30800052 ~ 30801988 (+) True XLOC_014128
TCONS_00029956 lncRNA downstream 313717 30832290 ~ 30836205 (+) True XLOC_014129
TCONS_00028141 mRNA upstream 1775 30495109 ~ 30516680 (+) True XLOC_014122
TCONS_00028140 mRNA upstream 50221 30450125 ~ 30468234 (+) True XLOC_014121
TCONS_00028139 mRNA upstream 89554 30423117 ~ 30428901 (+) True XLOC_014120
TCONS_00028138 mRNA upstream 118579 30388186 ~ 30399876 (+) True XLOC_014119
TCONS_00028137 mRNA upstream 119277 30387999 ~ 30399178 (+) False XLOC_014119
TCONS_00028146 mRNA downstream 114880 30633453 ~ 30683678 (+) False XLOC_014126
TCONS_00028147 mRNA downstream 143956 30662529 ~ 30684874 (+) True XLOC_014126
TCONS_00028148 mRNA downstream 349272 30867845 ~ 30884054 (+) False XLOC_014131
TCONS_00028150 mRNA downstream 366133 30884706 ~ 30895272 (+) False XLOC_014132
TCONS_00028151 mRNA downstream 366387 30884960 ~ 30891182 (+) False XLOC_014132
TCONS_00028136 other upstream 658121 29859036 ~ 29860334 (+) True XLOC_014118
TCONS_00028134 other upstream 658249 29854249 ~ 29860206 (+) False XLOC_014118
TCONS_00028123 other upstream 1197572 29303847 ~ 29320883 (+) False XLOC_014112
TCONS_00028122 other upstream 1315198 29203142 ~ 29203257 (+) True XLOC_014111
TCONS_00028118 other upstream 2184291 28331227 ~ 28334164 (+) True XLOC_014108
TCONS_00028145 other downstream 112370 30630943 ~ 30631060 (+) True XLOC_014125
TCONS_00028149 other downstream 361215 30879788 ~ 30882456 (+) True XLOC_014131
TCONS_00028153 other downstream 366411 30884984 ~ 30887251 (+) False XLOC_014132
TCONS_00028157 other downstream 366739 30885312 ~ 30891010 (+) True XLOC_014132
TCONS_00028165 other downstream 823450 31342023 ~ 31348348 (+) True XLOC_014139