RNA id: TCONS_00028183



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00028183
length 123
RNA type rRNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_014151
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 32058477 ~ 32058599 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


AGCAGCATAGTATATTTGCttctagctctctgcaactcacatggttgcccacttaAGCTGAGCAGCTCTGTGCCTgattagtacctggatgggagacgacataggaaagctaggttgctgctg

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000164534

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00029968 lncRNA upstream 88711 31954959 ~ 31969766 (+) True XLOC_014150
TCONS_00029965 lncRNA upstream 103749 31943508 ~ 31954728 (+) False XLOC_014149
TCONS_00029966 lncRNA upstream 103749 31943620 ~ 31954728 (+) False XLOC_014149
TCONS_00029967 lncRNA upstream 103749 31943627 ~ 31954728 (+) True XLOC_014149
TCONS_00029964 lncRNA upstream 176100 31875019 ~ 31882377 (+) True XLOC_014147
TCONS_00029969 lncRNA downstream 199016 32257615 ~ 32368512 (+) False XLOC_014155
TCONS_00029970 lncRNA downstream 657979 32716578 ~ 32718796 (+) True XLOC_014158
TCONS_00029971 lncRNA downstream 706684 32765283 ~ 32780918 (+) True XLOC_014159
TCONS_00028211 lncRNA downstream 1406110 33464709 ~ 33477475 (+) False XLOC_014167
TCONS_00029972 lncRNA downstream 1495014 33553613 ~ 33660936 (+) False XLOC_014168
TCONS_00028182 mRNA upstream 119438 31905002 ~ 31939039 (+) True XLOC_014148
TCONS_00028180 mRNA upstream 119447 31904912 ~ 31939030 (+) False XLOC_014148
TCONS_00028181 mRNA upstream 119529 31904927 ~ 31938948 (+) False XLOC_014148
TCONS_00028179 mRNA upstream 119680 31904836 ~ 31938797 (+) False XLOC_014148
TCONS_00028178 mRNA upstream 162882 31873308 ~ 31895595 (+) False XLOC_014147
TCONS_00028184 mRNA downstream 99411 32158010 ~ 32164532 (+) True XLOC_014152
TCONS_00028185 mRNA downstream 108103 32166702 ~ 32169161 (+) True XLOC_014153
TCONS_00028186 mRNA downstream 143392 32201991 ~ 32206819 (+) True XLOC_014154
TCONS_00028187 mRNA downstream 198873 32257472 ~ 32461596 (+) False XLOC_014155
TCONS_00028188 mRNA downstream 263198 32321797 ~ 32461596 (+) False XLOC_014155
TCONS_00028175 other upstream 466937 31591524 ~ 31591540 (+) True XLOC_014144
TCONS_00028174 other upstream 467986 31587931 ~ 31590491 (+) True XLOC_014142
TCONS_00028165 other upstream 710129 31342023 ~ 31348348 (+) True XLOC_014139
TCONS_00028157 other upstream 1167467 30885312 ~ 30891010 (+) True XLOC_014132
TCONS_00028153 other upstream 1171226 30884984 ~ 30887251 (+) False XLOC_014132
TCONS_00028194 other downstream 755721 32814320 ~ 32818574 (+) True XLOC_014160
TCONS_00028217 other downstream 1673563 33732162 ~ 33765725 (+) False XLOC_014168
TCONS_00028221 other downstream 2077008 34135607 ~ 34135695 (+) True XLOC_014171
TCONS_00028225 other downstream 2148563 34207162 ~ 34207280 (+) True XLOC_014173
TCONS_00028229 other downstream 2684107 34742706 ~ 34746733 (+) False XLOC_014179