RNA id: TCONS_00028225



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00028225
length 119
RNA type rRNA
GC content 0.54
exon number 1
gene id XLOC_014173
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 34207162 ~ 34207280 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GCTGGCAGCTtgctttctgcaactctcacatggtcgctcactgaagctaagcagggctgtgcccatgagtatctggatgggagaccacatgggaaagctactgtagattgctgccggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000117794

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00029975 lncRNA upstream 408752 33795748 ~ 33798410 (+) True XLOC_014169
TCONS_00029973 lncRNA upstream 516802 33553634 ~ 33690360 (+) False XLOC_014168
TCONS_00029974 lncRNA upstream 516802 33574314 ~ 33690360 (+) False XLOC_014168
TCONS_00029972 lncRNA upstream 546226 33553613 ~ 33660936 (+) False XLOC_014168
TCONS_00028211 lncRNA upstream 729687 33464709 ~ 33477475 (+) False XLOC_014167
TCONS_00029976 lncRNA downstream 73484 34280764 ~ 34281978 (+) True XLOC_014176
TCONS_00029977 lncRNA downstream 494397 34701677 ~ 34738365 (+) True XLOC_014178
TCONS_00029978 lncRNA downstream 541758 34749038 ~ 34751777 (+) True XLOC_014180
TCONS_00029979 lncRNA downstream 680295 34887575 ~ 34914799 (+) True XLOC_014181
TCONS_00029980 lncRNA downstream 1154200 35361480 ~ 35363590 (+) True XLOC_014185
TCONS_00028220 mRNA upstream 330917 33850705 ~ 33876245 (+) True XLOC_014170
TCONS_00028215 mRNA upstream 421248 33701558 ~ 33785914 (+) False XLOC_014168
TCONS_00028226 mRNA downstream 22828 34230108 ~ 34259666 (+) True XLOC_014174
TCONS_00028227 mRNA downstream 67224 34274504 ~ 34279173 (+) True XLOC_014175
TCONS_00028228 mRNA downstream 104094 34311374 ~ 34679738 (+) True XLOC_014177
TCONS_00028230 mRNA downstream 535426 34742706 ~ 34746878 (+) True XLOC_014179
TCONS_00028231 mRNA downstream 742920 34950200 ~ 34958185 (+) False XLOC_014182
TCONS_00028221 other upstream 71467 34135607 ~ 34135695 (+) True XLOC_014171
TCONS_00028217 other upstream 441437 33732162 ~ 33765725 (+) False XLOC_014168
TCONS_00028194 other upstream 1388588 32814320 ~ 32818574 (+) True XLOC_014160
TCONS_00028183 other upstream 2148563 32058477 ~ 32058599 (+) True XLOC_014151
TCONS_00028175 other upstream 2615622 31591524 ~ 31591540 (+) True XLOC_014144
TCONS_00028229 other downstream 535426 34742706 ~ 34746733 (+) False XLOC_014179
TCONS_00028237 other downstream 1571562 35778842 ~ 35778957 (+) True XLOC_014189
TCONS_00028239 other downstream 1995798 36203078 ~ 36203195 (+) True XLOC_014193
TCONS_00028240 other downstream 2035511 36242791 ~ 36242908 (+) True XLOC_014194
TCONS_00028243 other downstream 2472811 36680091 ~ 36680207 (+) True XLOC_014197

Expression Profile


//