RNA id: TCONS_00028237



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00028237
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_014189
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 35778842 ~ 35778957 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TGCCACAGCCATATAACCCTGCAGCCCaggaccagttactcactgagctaagcagggctgagcctggtctaTACCTAGATAGGAGACAACATGGGAAAAACAGGTTGCTGttgtgt

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000177316

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00029999 lncRNA upstream 55467 35720977 ~ 35723375 (+) True XLOC_014188
TCONS_00029985 lncRNA upstream 398857 35373533 ~ 35379985 (+) False XLOC_014187
TCONS_00029987 lncRNA upstream 398857 35373533 ~ 35379985 (+) False XLOC_014187
TCONS_00029989 lncRNA upstream 398857 35373533 ~ 35379985 (+) False XLOC_014187
TCONS_00029991 lncRNA upstream 398857 35373533 ~ 35379985 (+) False XLOC_014187
TCONS_00030001 lncRNA downstream 84252 35863209 ~ 35934775 (+) False XLOC_014191
TCONS_00030000 lncRNA downstream 84252 35863209 ~ 35934775 (+) False XLOC_014191
TCONS_00030002 lncRNA downstream 84252 35863209 ~ 36018954 (+) False XLOC_014191
TCONS_00029727 lncRNA downstream 84314 35863271 ~ 35934328 (+) False XLOC_014191
TCONS_00030003 lncRNA downstream 84314 35863271 ~ 35934775 (+) False XLOC_014191
TCONS_00028234 mRNA upstream 761795 35013129 ~ 35017047 (+) False XLOC_014184
TCONS_00028235 mRNA upstream 762547 35013212 ~ 35016295 (+) True XLOC_014184
TCONS_00028233 mRNA upstream 773895 35002479 ~ 35004947 (+) True XLOC_014183
TCONS_00028231 mRNA upstream 820657 34950200 ~ 34958185 (+) False XLOC_014182
TCONS_00028232 mRNA upstream 820954 34952582 ~ 34957888 (+) True XLOC_014182
TCONS_00028238 mRNA downstream 20427 35799384 ~ 35852390 (+) True XLOC_014190
TCONS_00028244 mRNA downstream 1339590 37118547 ~ 37119891 (+) True XLOC_014198
TCONS_00028245 mRNA downstream 1341534 37120491 ~ 37134211 (+) True XLOC_014199
TCONS_00028246 mRNA downstream 1356743 37135700 ~ 37139452 (+) True XLOC_014200
TCONS_00028247 mRNA downstream 1679653 37458610 ~ 37492517 (+) True XLOC_014201
TCONS_00028229 other upstream 1032109 34742706 ~ 34746733 (+) False XLOC_014179
TCONS_00028225 other upstream 1571562 34207162 ~ 34207280 (+) True XLOC_014173
TCONS_00028221 other upstream 1643147 34135607 ~ 34135695 (+) True XLOC_014171
TCONS_00028217 other upstream 2013117 33732162 ~ 33765725 (+) False XLOC_014168
TCONS_00028194 other upstream 2960268 32814320 ~ 32818574 (+) True XLOC_014160
TCONS_00028239 other downstream 424121 36203078 ~ 36203195 (+) True XLOC_014193
TCONS_00028240 other downstream 463834 36242791 ~ 36242908 (+) True XLOC_014194
TCONS_00028243 other downstream 901134 36680091 ~ 36680207 (+) True XLOC_014197
TCONS_00028250 other downstream 1890703 37669660 ~ 37669774 (+) True XLOC_014206
TCONS_00028259 other downstream 2477319 38256276 ~ 38256392 (+) True XLOC_014211