RNA id: TCONS_00028259



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00028259
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.48
exon number 1
gene id XLOC_014211
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 38256276 ~ 38256392 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TGCcgcagccatatcaccctgctgcCCAAGACCGgtaactcactgaagctaagcagggataagctaggtcagtacctggatggaataTCACATAGGAAAACTAGGTTTCTGTTgtaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000175470

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00030010 lncRNA upstream 236181 38017599 ~ 38020095 (+) True XLOC_014209
TCONS_00029728 lncRNA upstream 307990 37937807 ~ 37948286 (+) True XLOC_014208
TCONS_00030009 lncRNA upstream 685600 37569661 ~ 37570676 (+) True XLOC_014204
TCONS_00030008 lncRNA upstream 757597 37494319 ~ 37498679 (+) True XLOC_014202
TCONS_00030007 lncRNA upstream 1628642 36625129 ~ 36627634 (+) False XLOC_014196
TCONS_00030011 lncRNA downstream 122007 38378399 ~ 38384624 (+) True XLOC_014212
TCONS_00030012 lncRNA downstream 199242 38455634 ~ 38467600 (+) False XLOC_014213
TCONS_00030013 lncRNA downstream 217048 38473440 ~ 38475865 (+) True XLOC_014214
TCONS_00030014 lncRNA downstream 476702 38733094 ~ 38777734 (+) False XLOC_014215
TCONS_00030015 lncRNA downstream 476702 38733094 ~ 38778761 (+) True XLOC_014215
TCONS_00028253 mRNA upstream 328235 37848830 ~ 37928041 (+) False XLOC_014207
TCONS_00028252 mRNA upstream 328235 37848830 ~ 37928041 (+) False XLOC_014207
TCONS_00028254 mRNA upstream 328785 37857936 ~ 37927491 (+) False XLOC_014207
TCONS_00028255 mRNA upstream 329851 37925616 ~ 37926425 (+) True XLOC_014207
TCONS_00028249 mRNA upstream 414273 37620342 ~ 37842003 (+) False XLOC_014205
TCONS_00028261 mRNA downstream 165667 38422059 ~ 38467554 (+) False XLOC_014213
TCONS_00028269 mRNA downstream 1769649 40026041 ~ 40039906 (+) False XLOC_014223
TCONS_00028270 mRNA downstream 1770567 40026959 ~ 40028071 (+) False XLOC_014223
TCONS_00028272 mRNA downstream 1813132 40069524 ~ 40113608 (+) False XLOC_014225
TCONS_00028273 mRNA downstream 1813132 40069524 ~ 40113935 (+) False XLOC_014225
TCONS_00028250 other upstream 586502 37669660 ~ 37669774 (+) True XLOC_014206
TCONS_00028243 other upstream 1576069 36680091 ~ 36680207 (+) True XLOC_014197
TCONS_00028240 other upstream 2013368 36242791 ~ 36242908 (+) True XLOC_014194
TCONS_00028239 other upstream 2053081 36203078 ~ 36203195 (+) True XLOC_014193
TCONS_00028237 other upstream 2477319 35778842 ~ 35778957 (+) True XLOC_014189
TCONS_00028260 other downstream 165667 38422059 ~ 38426683 (+) False XLOC_014213
TCONS_00028262 other downstream 207739 38464131 ~ 38466651 (+) True XLOC_014213
TCONS_00028264 other downstream 692180 38948572 ~ 38948686 (+) True XLOC_014217
TCONS_00028266 other downstream 1618439 39874831 ~ 39874947 (+) True XLOC_014221
TCONS_00028268 other downstream 1769536 40025928 ~ 40055391 (+) False XLOC_014223

Expression Profile


//