RNA id: TCONS_00028283


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00028283
length 123
RNA type mRNA
GC content 0.42
exon number 6
gene id XLOC_014227
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 40171960 ~ 40212192 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CTCCTGAAGATCTTGAAGCTTTTTCTGAAAGTTATGgtgaaagctgaccagccatTTGTAGACAGACTCCTCCCAGTGCAATTACTGGAAACTTCATCAGttgtcataGtctGTGATGctcaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000184876

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00028282 lncRNA upstream 8689 40156777 ~ 40163271 (+) True XLOC_014226
TCONS_00030021 lncRNA upstream 42354 40116262 ~ 40129606 (+) False XLOC_014226
TCONS_00028280 lncRNA upstream 42354 40126475 ~ 40129606 (+) False XLOC_014226
TCONS_00028279 lncRNA upstream 44939 40122409 ~ 40127021 (+) False XLOC_014226
TCONS_00029730 lncRNA upstream 105369 40057836 ~ 40066591 (+) True XLOC_014224
TCONS_00030027 lncRNA downstream 118320 40328712 ~ 40333094 (+) False XLOC_014230
TCONS_00030026 lncRNA downstream 118320 40328712 ~ 40333094 (+) True XLOC_014230
TCONS_00028294 lncRNA downstream 127172 40337564 ~ 40340629 (+) True XLOC_014231
TCONS_00030028 lncRNA downstream 482036 40692428 ~ 40736984 (+) True XLOC_014234
TCONS_00030029 lncRNA downstream 977420 41187812 ~ 41191519 (+) True XLOC_014243
TCONS_00028277 mRNA upstream 6161 40122160 ~ 40165799 (+) False XLOC_014226
TCONS_00028281 mRNA upstream 6161 40145400 ~ 40165799 (+) False XLOC_014226
TCONS_00028275 mRNA upstream 42476 40115977 ~ 40129484 (+) False XLOC_014226
TCONS_00028278 mRNA upstream 42734 40122370 ~ 40129226 (+) False XLOC_014226
TCONS_00028273 mRNA upstream 58025 40069524 ~ 40113935 (+) False XLOC_014225
TCONS_00028287 mRNA downstream 38305 40248697 ~ 40328549 (+) False XLOC_014229
TCONS_00028288 mRNA downstream 40290 40250682 ~ 40324288 (+) False XLOC_014229
TCONS_00028289 mRNA downstream 112520 40322912 ~ 40324609 (+) True XLOC_014229
TCONS_00028290 mRNA downstream 124879 40335271 ~ 40344757 (+) False XLOC_014231
TCONS_00028291 mRNA downstream 127065 40337457 ~ 40347943 (+) False XLOC_014231
TCONS_00028276 other upstream 45196 40116262 ~ 40126764 (+) False XLOC_014226
TCONS_00028268 other upstream 116569 40025928 ~ 40055391 (+) False XLOC_014223
TCONS_00028266 other upstream 297013 39874831 ~ 39874947 (+) True XLOC_014221
TCONS_00028264 other upstream 1223274 38948572 ~ 38948686 (+) True XLOC_014217
TCONS_00028262 other upstream 1705309 38464131 ~ 38466651 (+) True XLOC_014213
TCONS_00028293 other downstream 127162 40337554 ~ 40344737 (+) False XLOC_014231
TCONS_00028303 other downstream 748108 40958500 ~ 40958616 (+) True XLOC_014238
TCONS_00028333 other downstream 1978598 42188990 ~ 42189104 (+) True XLOC_014257
TCONS_00028342 other downstream 2126925 42337317 ~ 42337431 (+) True XLOC_014261
TCONS_00028353 other downstream 2522296 42732688 ~ 42735285 (+) False XLOC_014270