RNA id: TCONS_00028911


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00028911
length 136
RNA type snoRNA
GC content 0.43
exon number 1
gene id XLOC_014626
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 12136736 ~ 12136871 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGCAGCCTTGTCAAATTTAGTGTTTACTTCTCAGTAGATCACACTGGCCAAAATGGCTGCCACAGTACATTTTTAGTCCTCGAGCCTCATGATCTTGCCTTGTGGCTATTGTGGATAGAAGTGGCTATATACAGTT

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000121265

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00030168 lncRNA downstream 909168 11219761 ~ 11227568 (-) True XLOC_014612
TCONS_00028870 lncRNA downstream 1259906 10875733 ~ 10876830 (-) False XLOC_014603
TCONS_00028865 lncRNA downstream 1271937 10859194 ~ 10864799 (-) False XLOC_014603
TCONS_00028866 lncRNA downstream 1276287 10859122 ~ 10860449 (-) False XLOC_014603
TCONS_00028835 lncRNA downstream 1817774 10313927 ~ 10318962 (-) True XLOC_014586
TCONS_00028922 lncRNA upstream 261673 12398544 ~ 12404316 (-) False XLOC_014631
TCONS_00030169 lncRNA upstream 484055 12620926 ~ 12623962 (-) True XLOC_014632
TCONS_00030170 lncRNA upstream 830148 12967019 ~ 13008216 (-) False XLOC_014635
TCONS_00030171 lncRNA upstream 830148 12967019 ~ 13009415 (-) True XLOC_014635
TCONS_00030172 lncRNA upstream 1049082 13185953 ~ 13188728 (-) True XLOC_014636
TCONS_00028904 mRNA downstream 58153 12030832 ~ 12078583 (-) True XLOC_014622
TCONS_00028902 mRNA downstream 158953 11952309 ~ 11977783 (-) False XLOC_014621
TCONS_00028901 mRNA downstream 161572 11948559 ~ 11975164 (-) False XLOC_014621
TCONS_00028903 mRNA downstream 170721 11955335 ~ 11966015 (-) True XLOC_014621
TCONS_00028900 mRNA downstream 186740 11899391 ~ 11949996 (-) False XLOC_014621
TCONS_00028912 mRNA upstream 27557 12164428 ~ 12193622 (-) True XLOC_014627
TCONS_00028913 mRNA upstream 69287 12206158 ~ 12212694 (-) False XLOC_014628
TCONS_00028914 mRNA upstream 69287 12206158 ~ 12212796 (-) False XLOC_014628
TCONS_00028915 mRNA upstream 69484 12206355 ~ 12212772 (-) False XLOC_014628
TCONS_00028916 mRNA upstream 69950 12206821 ~ 12212692 (-) True XLOC_014628
TCONS_00028907 other downstream 5556 12131045 ~ 12131180 (-) True XLOC_014625
TCONS_00028905 other downstream 90166 12046454 ~ 12046570 (-) True XLOC_014623
TCONS_00028897 other downstream 411105 11725496 ~ 11725631 (-) True XLOC_014620
TCONS_00028885 other downstream 943373 11193249 ~ 11193363 (-) True XLOC_014611
TCONS_00028867 other downstream 1276270 10859217 ~ 10860466 (-) False XLOC_014603
TCONS_00028921 other upstream 249426 12386297 ~ 12392758 (-) True XLOC_014630
TCONS_00028926 other upstream 496278 12633149 ~ 12633263 (-) True XLOC_014634
TCONS_00028935 other upstream 1596297 13733168 ~ 13774469 (-) True XLOC_014640
TCONS_00028954 other upstream 3037972 15174843 ~ 15192646 (-) True XLOC_014651
TCONS_00028962 other upstream 3890548 16027419 ~ 16027490 (-) True XLOC_014658

Expression Profile

//