RNA id: TU243992


Basic Information

Item Value
RNA id TU243992
length 2481
lncRNA type inter_gene
GC content 0.36
exon number 2
gene id G214549
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 29481 ~ 35087 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome
species rainbow trout
(Oncorhynchus mykiss)

Sequence

agatctactgtctattataatatgacagaccagctagatctactttctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagcttgatctactgtctcttttaacttatgacagaccagctagatctactttctctattatattatgacacaccagctagatctactgtctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattacattatgacataccagctagatctactgcctctatgtctatattatattgacagatcagctagatctactgtctctattatattatgactgaccagctagatctactgcctctatgatattatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagacctgctagatctactgtctctattatattatgacataccagctagatctactgcctctatgtctctattatattgacagaccagctagatctactgtctctattgtattatgactgaccagctagatctactatctctattataatatgacagaccagctagatctactgtcactattatattatgacacaccagctagatctactgcctctatgtctctattatattgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgactgaccagctagatctactgcctctatgatattatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattctgacagaccagctagatctactgtctctattacattatgacataccagctagatctactgcctctatgtctatattatattgacagatcagctagatctactgtctctattatattatgactgaccagctagatctactgcctctatgatattatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagacctgctagatctactgtctctattatattatgacataccagctagatctactgcctctatgtctctattatattgacagaccagctagatctactgtctctattgtattatgactgaccagctagatctactatctctattataatatgacagaccagctagatctactgtcactattatattatgacacaccagctagatctactgcctctatgtctctattatattgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgactgaccagctagatctactgcctctatgatattatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattctgacagaccagctacatctactgtctctattatattttgacagaccagctagatctaccgtctctattatattatgacataccagctagatctactgtctctatattatgattgaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctaggtctactgtctctattatattctgacagaccagatagatcgattgtctctatcataatatgacagaccagcttgatctactgtctctattatattctgacagaccagctacatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgactgaccagctagatatactgtctattatattatgactgaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctccattatattatgacataccagctagatctactgcctctatgtctctattatattgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgactgaccagctagatctactgtctctattatattttgacagaagagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctactatattatgacagaccagctagttctactgtctctattataatatgaaagaccagctagatctactgtctctaatatattatgactgaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattataacatgacagacctgctagatctactgtctctattatattgtgacataccagctagatctactgtctctatgtctctattatattgacagaccagctagatctacattctctattgtattatgactgaccagctagatctactatctcttatataatatgacagaccagctagatcagctgtctctattataaaatgacagaccagctagatctactgtctctatgtctctattatattatgaca

Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU243979 lncRNA upstream 6567 41654 ~ 50384 (-) False G214545
TU243988 lncRNA upstream 11301 46388 ~ 52028 (-) True G214545
TU244069 lncRNA upstream 72934 108021 ~ 108619 (-) True G214597
TU244071 lncRNA upstream 74267 109354 ~ 110345 (-) True G214599
TU244084 lncRNA upstream 89018 124105 ~ 124816 (-) False G214609
XM_036975416.1 mRNA upstream 28829 63916 ~ 74553 (-) False LOC118964342
XM_036965278.1 mRNA upstream 112653 147740 ~ 155571 (-) True irx4a
XR_005040024.1 mRNA upstream 213951 249038 ~ 250513 (-) False LOC118944729
XR_005040030.1 mRNA upstream 213951 249038 ~ 250513 (-) False LOC118944729
XR_005040023.1 mRNA upstream 213951 249038 ~ 250548 (-) False LOC118944729
TU244046 other upstream 35007 70094 ~ 74551 (-) True LOC118964342
TU244156 other upstream 142636 177723 ~ 179591 (-) False G214663
TU244157 other upstream 142636 177723 ~ 178387 (-) False G214663
TU244160 other upstream 142636 177723 ~ 179591 (-) True G214663
TU244568 other upstream 445960 481047 ~ 481609 (-) True G214982

Expression Profile