RNA id: TCONS_00029142



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00029142
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.48
exon number 1
gene id XLOC_014740
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 22646182 ~ 22646299 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TcaagccatatcaccctgcagcccaagaccagttactcactaaagctaagcagggctgagcctggtcagtacctgaaagTGAGACCGACCACATGAGATAAATTGGTAGCTGTTTGAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000120690

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00030216 lncRNA downstream 584128 22059711 ~ 22062054 (-) True XLOC_014734
TCONS_00030215 lncRNA downstream 606680 22034197 ~ 22039502 (-) True XLOC_014733
TCONS_00029119 lncRNA downstream 813681 21825823 ~ 21832501 (-) True XLOC_014732
TCONS_00030214 lncRNA downstream 1278990 21362921 ~ 21367192 (-) False XLOC_014730
TCONS_00030218 lncRNA upstream 319487 22965786 ~ 22969561 (-) False XLOC_014742
TCONS_00030217 lncRNA upstream 319487 22965786 ~ 22969561 (-) True XLOC_014742
TCONS_00029774 lncRNA upstream 405679 23051978 ~ 23052426 (-) False XLOC_014747
TCONS_00030219 lncRNA upstream 638895 23285194 ~ 23288120 (-) True XLOC_014754
TCONS_00030220 lncRNA upstream 658863 23305162 ~ 23305720 (-) True XLOC_014755
TCONS_00029134 mRNA downstream 24191 22410377 ~ 22621991 (-) False XLOC_014738
TCONS_00029133 mRNA downstream 35630 22410377 ~ 22610552 (-) False XLOC_014738
TCONS_00029132 mRNA downstream 55504 22410377 ~ 22590678 (-) False XLOC_014738
TCONS_00029131 mRNA downstream 77979 22410377 ~ 22568203 (-) False XLOC_014738
TCONS_00029130 mRNA downstream 104530 22410377 ~ 22541652 (-) False XLOC_014738
TCONS_00029143 mRNA upstream 112817 22759116 ~ 22843480 (-) True XLOC_014741
TCONS_00029153 mRNA upstream 489871 23136170 ~ 23249822 (-) False XLOC_014752
TCONS_00029154 mRNA upstream 490650 23136949 ~ 23227582 (-) True XLOC_014752
TCONS_00029156 mRNA upstream 721702 23368001 ~ 23369282 (-) False XLOC_014756
TCONS_00029157 mRNA upstream 735032 23381331 ~ 23382619 (-) True XLOC_014757
TCONS_00029100 other downstream 1529639 21116411 ~ 21116543 (-) True XLOC_014728
TCONS_00029097 other downstream 2206922 20439142 ~ 20439260 (-) True XLOC_014725
TCONS_00029085 other downstream 2376041 20251672 ~ 20270141 (-) False XLOC_014721
TCONS_00029077 other downstream 2497733 20143850 ~ 20148449 (-) False XLOC_014717
TCONS_00029070 other downstream 2784670 19822162 ~ 19861512 (-) True XLOC_014710
TCONS_00029144 other upstream 396187 23042486 ~ 23042956 (-) True XLOC_014743
TCONS_00029145 other upstream 400501 23046800 ~ 23047282 (-) True XLOC_014744
TCONS_00029146 other upstream 401618 23047917 ~ 23048219 (-) True XLOC_014745
TCONS_00029147 other upstream 404478 23050777 ~ 23051016 (-) True XLOC_014746
TCONS_00029148 other upstream 405679 23051978 ~ 23052463 (-) True XLOC_014747