RNA id: TCONS_00029150


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00029150
length 287
RNA type IG_V_pseudogene
GC content 0.44
exon number 1
gene id XLOC_014749
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 23114196 ~ 23114482 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGTCTCATCAAGAGGTTCAGTCTCTTGAGTCTCTGTCTGTAAAAGCAGGGGATTCTGCTTCTATCAGCTGTAATGGGACAAATGGAGTTGATGACATGAGCTGGTATTTGCAGAAACCTGAAAAGCTCCTAAACTCCTGATATATAAGACAAGTCGACTTCAATCTGGAGTTTCTAATCGATTCAGTGGAAGTCAGTCTAGACTTCATTTTACACTGAACATGTGTGCAGTCCAGCCAGAAGATGCAGGAGTTTATCACTGTATGGGGGCTTACAGCTACGGGCGCA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000145372

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00029774 lncRNA downstream 61770 23051978 ~ 23052426 (-) False XLOC_014747
TCONS_00030218 lncRNA downstream 144635 22965786 ~ 22969561 (-) False XLOC_014742
TCONS_00030217 lncRNA downstream 144635 22965786 ~ 22969561 (-) True XLOC_014742
TCONS_00030216 lncRNA downstream 1052142 22059711 ~ 22062054 (-) True XLOC_014734
TCONS_00030215 lncRNA downstream 1074694 22034197 ~ 22039502 (-) True XLOC_014733
TCONS_00030219 lncRNA upstream 170712 23285194 ~ 23288120 (-) True XLOC_014754
TCONS_00030220 lncRNA upstream 190680 23305162 ~ 23305720 (-) True XLOC_014755
TCONS_00030221 lncRNA upstream 254397 23368879 ~ 23369252 (-) True XLOC_014756
TCONS_00030222 lncRNA upstream 295533 23410015 ~ 23411861 (-) True XLOC_014758
TCONS_00030223 lncRNA upstream 321476 23435958 ~ 23436487 (-) False XLOC_014760
TCONS_00029143 mRNA downstream 270716 22759116 ~ 22843480 (-) True XLOC_014741
TCONS_00029137 mRNA downstream 449798 22622355 ~ 22664398 (-) False XLOC_014739
TCONS_00029138 mRNA downstream 450068 22624268 ~ 22664128 (-) False XLOC_014739
TCONS_00029135 mRNA downstream 572912 22453441 ~ 22541284 (-) False XLOC_014738
TCONS_00029153 mRNA upstream 21688 23136170 ~ 23249822 (-) False XLOC_014752
TCONS_00029154 mRNA upstream 22467 23136949 ~ 23227582 (-) True XLOC_014752
TCONS_00029156 mRNA upstream 253519 23368001 ~ 23369282 (-) False XLOC_014756
TCONS_00029157 mRNA upstream 266849 23381331 ~ 23382619 (-) True XLOC_014757
TCONS_00029158 mRNA upstream 303596 23418078 ~ 23419342 (-) True XLOC_014759
TCONS_00029149 other downstream 49358 23064025 ~ 23064838 (-) True XLOC_014748
TCONS_00029148 other downstream 61733 23051978 ~ 23052463 (-) True XLOC_014747
TCONS_00029147 other downstream 63180 23050777 ~ 23051016 (-) True XLOC_014746
TCONS_00029146 other downstream 65977 23047917 ~ 23048219 (-) True XLOC_014745
TCONS_00029145 other downstream 66914 23046800 ~ 23047282 (-) True XLOC_014744
TCONS_00029151 other upstream 5916 23120398 ~ 23120927 (-) True XLOC_014750
TCONS_00029152 other upstream 14181 23128663 ~ 23129301 (-) True XLOC_014751
TCONS_00029155 other upstream 104995 23219477 ~ 23219595 (-) True XLOC_014753
TCONS_00029179 other upstream 783220 23897702 ~ 23918134 (-) False XLOC_014780
TCONS_00029181 other upstream 800734 23915216 ~ 23918106 (-) True XLOC_014780