RNA id: TCONS_00030221


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00030221
length 374
lncRNA type sense_over
GC content 0.44
exon number 1
gene id XLOC_014756
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 23368001 ~ 23369282 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

AGGAGATTGGAGAGGGAGGATTTGGCAGCGTCTATGAAGGCAAGCGCTTGGAGGATGGCCTtgaggtgaacaatccctttaacatATATTATGTTCACTTTTTAGTGCACTTGATGTGATCATAACAGAAGTGTTGTTTTGTTGAACAGGTGGCAGTAAAAATTGCCAGAAAGCCATCGAACATGAAATACATCAACATCGTAAGTAGACTTAAACATGTAAAGGCACTGACAACAGTATATTTGGGGAAGCAACACCGCCAAACTAATCTTTCTTCTAGGCTGGTCATCCTGAGCCCCTTCCTTTAGAGATCGGCCTGTTGATACTGGCTCATAGAGGCGGCAAGGTTCCAGAGATCATTGAGCTGCTGGACT

Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00030220 lncRNA downstream 63159 23305162 ~ 23305720 (-) True XLOC_014755
TCONS_00030219 lncRNA downstream 80759 23285194 ~ 23288120 (-) True XLOC_014754
TCONS_00029774 lncRNA downstream 316453 23051978 ~ 23052426 (-) False XLOC_014747
TCONS_00030218 lncRNA downstream 399318 22965786 ~ 22969561 (-) False XLOC_014742
TCONS_00030217 lncRNA downstream 399318 22965786 ~ 22969561 (-) True XLOC_014742
TCONS_00030222 lncRNA upstream 40763 23410015 ~ 23411861 (-) True XLOC_014758
TCONS_00030223 lncRNA upstream 66706 23435958 ~ 23436487 (-) False XLOC_014760
TCONS_00030224 lncRNA upstream 67659 23436911 ~ 23437397 (-) True XLOC_014760
TCONS_00030225 lncRNA upstream 157026 23526278 ~ 23526561 (-) True XLOC_014764
TCONS_00030226 lncRNA upstream 255861 23625113 ~ 23627905 (-) False XLOC_014768
TCONS_00029153 mRNA downstream 119057 23136170 ~ 23249822 (-) False XLOC_014752
TCONS_00029154 mRNA downstream 141297 23136949 ~ 23227582 (-) True XLOC_014752
TCONS_00029143 mRNA downstream 525399 22759116 ~ 22843480 (-) True XLOC_014741
TCONS_00029137 mRNA downstream 704481 22622355 ~ 22664398 (-) False XLOC_014739
TCONS_00029138 mRNA downstream 704751 22624268 ~ 22664128 (-) False XLOC_014739
TCONS_00029157 mRNA upstream 12079 23381331 ~ 23382619 (-) True XLOC_014757
TCONS_00029158 mRNA upstream 48826 23418078 ~ 23419342 (-) True XLOC_014759
TCONS_00029159 mRNA upstream 66881 23436133 ~ 23437400 (-) False XLOC_014760
TCONS_00029160 mRNA upstream 81241 23450493 ~ 23452345 (-) True XLOC_014761
TCONS_00029161 mRNA upstream 99519 23468771 ~ 23470709 (-) True XLOC_014762
TCONS_00029155 other downstream 149284 23219477 ~ 23219595 (-) True XLOC_014753
TCONS_00029152 other downstream 239578 23128663 ~ 23129301 (-) True XLOC_014751
TCONS_00029151 other downstream 247952 23120398 ~ 23120927 (-) True XLOC_014750
TCONS_00029150 other downstream 254397 23114196 ~ 23114482 (-) True XLOC_014749
TCONS_00029149 other downstream 304041 23064025 ~ 23064838 (-) True XLOC_014748
TCONS_00029179 other upstream 528450 23897702 ~ 23918134 (-) False XLOC_014780
TCONS_00029181 other upstream 545964 23915216 ~ 23918106 (-) True XLOC_014780
TCONS_00029186 other upstream 770528 24139780 ~ 24139894 (-) True XLOC_014784
TCONS_00029188 other upstream 813523 24182775 ~ 24182891 (-) True XLOC_014787
TCONS_00029189 other upstream 818342 24187594 ~ 24188743 (-) True XLOC_014788