RNA id: TCONS_00029169


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00029169
length 345
RNA type mRNA
GC content 0.42
exon number 2
gene id XLOC_014770
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 23672489 ~ 23674904 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ATGAGACGCTCCCGATTACAAGAAGTCATTTTTTTGGCCTCTGGCACTGATGATGTGGAGAGGGGCATCTCAAGCACAGTCATGGGGATTTACATAGTCCGAATTTATGACAACGGGGAGCCACAGGATGTGGGAATTGTGATCGAATGCATTAAAGTTCTGACCAACGTTGGCAGTGTCATCATGGGTTTTGTTGTACTGTTTGGGCTCATTTATGCCCTTGATCTGAGCTTTCCAGAAAACCTCAAGTACACCTTTGAGTTCATCCAGAAAATCATAATGAATCTGGATGGAGACAAGCTCAATTCAAAGATACAGCAGCTGaaaatcaaattgttttcttAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000187300

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00030226 lncRNA downstream 44584 23625113 ~ 23627905 (-) False XLOC_014768
TCONS_00030225 lncRNA downstream 145928 23526278 ~ 23526561 (-) True XLOC_014764
TCONS_00030224 lncRNA downstream 235092 23436911 ~ 23437397 (-) True XLOC_014760
TCONS_00030223 lncRNA downstream 236002 23435958 ~ 23436487 (-) False XLOC_014760
TCONS_00030222 lncRNA downstream 260628 23410015 ~ 23411861 (-) True XLOC_014758
TCONS_00030227 lncRNA upstream 45365 23720269 ~ 23723983 (-) False XLOC_014772
TCONS_00030228 lncRNA upstream 45365 23720269 ~ 23726829 (-) False XLOC_014772
TCONS_00030229 lncRNA upstream 47964 23722868 ~ 23723990 (-) True XLOC_014772
TCONS_00029775 lncRNA upstream 58383 23733287 ~ 23734065 (-) True XLOC_014773
TCONS_00030230 lncRNA upstream 93740 23768644 ~ 23769201 (-) True XLOC_014775
TCONS_00029168 mRNA downstream 10933 23660324 ~ 23661556 (-) True XLOC_014769
TCONS_00029167 mRNA downstream 44560 23625263 ~ 23627929 (-) True XLOC_014768
TCONS_00029166 mRNA downstream 77575 23592248 ~ 23594914 (-) True XLOC_014767
TCONS_00029165 mRNA downstream 96108 23573725 ~ 23576381 (-) True XLOC_014766
TCONS_00029164 mRNA downstream 122310 23548906 ~ 23550179 (-) True XLOC_014765
TCONS_00029170 mRNA upstream 33359 23708263 ~ 23709551 (-) True XLOC_014771
TCONS_00029171 mRNA upstream 70928 23745832 ~ 23747677 (-) True XLOC_014774
TCONS_00029172 mRNA upstream 92673 23767577 ~ 23768865 (-) False XLOC_014775
TCONS_00029173 mRNA upstream 119931 23794835 ~ 23797664 (-) False XLOC_014776
TCONS_00029174 mRNA upstream 121370 23796274 ~ 23799729 (-) True XLOC_014776
TCONS_00029155 other downstream 452894 23219477 ~ 23219595 (-) True XLOC_014753
TCONS_00029152 other downstream 543188 23128663 ~ 23129301 (-) True XLOC_014751
TCONS_00029151 other downstream 551562 23120398 ~ 23120927 (-) True XLOC_014750
TCONS_00029150 other downstream 558007 23114196 ~ 23114482 (-) True XLOC_014749
TCONS_00029149 other downstream 607651 23064025 ~ 23064838 (-) True XLOC_014748
TCONS_00029179 other upstream 222798 23897702 ~ 23918134 (-) False XLOC_014780
TCONS_00029181 other upstream 240312 23915216 ~ 23918106 (-) True XLOC_014780
TCONS_00029186 other upstream 464876 24139780 ~ 24139894 (-) True XLOC_014784
TCONS_00029188 other upstream 507871 24182775 ~ 24182891 (-) True XLOC_014787
TCONS_00029189 other upstream 512690 24187594 ~ 24188743 (-) True XLOC_014788

Expression Profile

//