RNA id: TCONS_00029188


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00029188
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_014787
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 24182775 ~ 24182891 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

Tttaacagccatatcaccctgtagcccaagaccggttactcactaaagctaagcagggctgagcttggtcagtacctggatgggagaccacatgggaaaactaggttgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000185146

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00029776 lncRNA downstream 37098 24141315 ~ 24145677 (-) True XLOC_014785
TCONS_00030232 lncRNA downstream 119548 23994034 ~ 24063227 (-) True XLOC_014781
TCONS_00030231 lncRNA downstream 325183 23857112 ~ 23857592 (-) True XLOC_014777
TCONS_00030230 lncRNA downstream 413574 23768644 ~ 23769201 (-) True XLOC_014775
TCONS_00029775 lncRNA downstream 448710 23733287 ~ 23734065 (-) True XLOC_014773
TCONS_00030233 lncRNA upstream 31382 24214273 ~ 24215346 (-) True XLOC_014790
TCONS_00030234 lncRNA upstream 205174 24388065 ~ 24393032 (-) True XLOC_014793
TCONS_00029777 lncRNA upstream 503819 24686710 ~ 24688179 (-) True XLOC_014798
TCONS_00030236 lncRNA upstream 569640 24752531 ~ 24758067 (-) False XLOC_014799
TCONS_00030235 lncRNA upstream 569640 24752531 ~ 24758067 (-) False XLOC_014799
TCONS_00029187 mRNA downstream 18930 24161712 ~ 24163845 (-) True XLOC_014786
TCONS_00029185 mRNA downstream 46542 24129466 ~ 24136233 (-) True XLOC_014783
TCONS_00029184 mRNA downstream 46951 24126775 ~ 24135824 (-) False XLOC_014783
TCONS_00029183 mRNA downstream 46951 24126775 ~ 24135824 (-) False XLOC_014783
TCONS_00029182 mRNA downstream 57318 24123409 ~ 24125457 (-) True XLOC_014782
TCONS_00029190 mRNA upstream 13197 24196088 ~ 24198139 (-) False XLOC_014789
TCONS_00029191 mRNA upstream 13197 24196088 ~ 24198184 (-) True XLOC_014789
TCONS_00029192 mRNA upstream 31334 24214225 ~ 24218942 (-) False XLOC_014790
TCONS_00029193 mRNA upstream 38977 24221868 ~ 24224142 (-) False XLOC_014791
TCONS_00029194 mRNA upstream 38977 24221868 ~ 24224292 (-) True XLOC_014791
TCONS_00029186 other downstream 42881 24139780 ~ 24139894 (-) True XLOC_014784
TCONS_00029179 other downstream 264641 23897702 ~ 23918134 (-) False XLOC_014780
TCONS_00029181 other downstream 264669 23915216 ~ 23918106 (-) True XLOC_014780
TCONS_00029155 other downstream 963180 23219477 ~ 23219595 (-) True XLOC_014753
TCONS_00029152 other downstream 1053474 23128663 ~ 23129301 (-) True XLOC_014751
TCONS_00029189 other upstream 4703 24187594 ~ 24188743 (-) True XLOC_014788
TCONS_00029209 other upstream 573952 24756843 ~ 24756974 (-) True XLOC_014800
TCONS_00029210 other upstream 574302 24757193 ~ 24757324 (-) True XLOC_014799
TCONS_00029214 other upstream 873921 25056812 ~ 25060877 (-) True XLOC_014804
TCONS_00029225 other upstream 963895 25146786 ~ 25148984 (-) True XLOC_014807

Expression Profile

//