RNA id: TCONS_00029233


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00029233
length 121
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_014813
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 25518420 ~ 25518540 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

tgcagctggaagggcatctgctgcatgtgCTAGAGTTAGCTACtcaatgaagctaagcagggctgagcctggtcagtacctggatgggagaccactagggaacactaggttgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000116199

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00029226 lncRNA downstream 361229 25155542 ~ 25157191 (-) True XLOC_014808
TCONS_00029224 lncRNA downstream 403753 25112796 ~ 25114667 (-) False XLOC_014807
TCONS_00029217 lncRNA downstream 432328 25084265 ~ 25086092 (-) False XLOC_014806
TCONS_00029216 lncRNA downstream 432328 25084265 ~ 25086092 (-) True XLOC_014806
TCONS_00029208 lncRNA downstream 760351 24756545 ~ 24758069 (-) False XLOC_014799
TCONS_00029239 lncRNA upstream 1211758 26730298 ~ 26736346 (-) False XLOC_014818
TCONS_00029241 lncRNA upstream 1213582 26732122 ~ 26736343 (-) True XLOC_014818
TCONS_00029778 lncRNA upstream 1261006 26779546 ~ 26780698 (-) True XLOC_014820
TCONS_00029779 lncRNA upstream 1268360 26786900 ~ 26788280 (-) True XLOC_014821
TCONS_00030237 lncRNA upstream 1285329 26803869 ~ 26807219 (-) True XLOC_014822
TCONS_00029230 mRNA downstream 54129 25435150 ~ 25464291 (-) True XLOC_014811
TCONS_00029229 mRNA downstream 91165 25352289 ~ 25427255 (-) True XLOC_014810
TCONS_00029228 mRNA downstream 216709 25163540 ~ 25301711 (-) True XLOC_014809
TCONS_00029227 mRNA downstream 247265 25163540 ~ 25271155 (-) False XLOC_014809
TCONS_00029219 mRNA downstream 368822 25088150 ~ 25149598 (-) False XLOC_014807
TCONS_00029234 mRNA upstream 138272 25656812 ~ 25678002 (-) True XLOC_014814
TCONS_00029235 mRNA upstream 160998 25679538 ~ 25693728 (-) True XLOC_014815
TCONS_00029236 mRNA upstream 180789 25699329 ~ 25772980 (-) True XLOC_014816
TCONS_00029237 mRNA upstream 643169 26161709 ~ 26235219 (-) True XLOC_014817
TCONS_00029238 mRNA upstream 1211758 26730298 ~ 26736336 (-) False XLOC_014818
TCONS_00029225 other downstream 369436 25146786 ~ 25148984 (-) True XLOC_014807
TCONS_00029214 other downstream 457543 25056812 ~ 25060877 (-) True XLOC_014804
TCONS_00029210 other downstream 761096 24757193 ~ 24757324 (-) True XLOC_014799
TCONS_00029209 other downstream 761446 24756843 ~ 24756974 (-) True XLOC_014800
TCONS_00029189 other downstream 1329677 24187594 ~ 24188743 (-) True XLOC_014788
TCONS_00029249 other upstream 1309641 26828181 ~ 26837124 (-) True XLOC_014824
TCONS_00029261 other upstream 1654174 27172714 ~ 27172830 (-) True XLOC_014831
TCONS_00029268 other upstream 1815990 27334530 ~ 27336629 (-) False XLOC_014832
TCONS_00029282 other upstream 1945876 27464416 ~ 27464482 (-) False XLOC_014836
TCONS_00029285 other upstream 1946564 27465104 ~ 27465170 (-) False XLOC_014836