RNA id: TCONS_00029261


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00029261
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_014831
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 27172714 ~ 27172830 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

tgccacagccatatcaccctgtagTCCAAGAGCagctactcactgaagctaagcagggctgatcCTGGttagtacctagatgggagaccagtagggaacactaggttgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000174917

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00029258 lncRNA downstream 165951 26991921 ~ 27006763 (-) True XLOC_014829
TCONS_00029254 lncRNA downstream 255164 26913424 ~ 26917550 (-) True XLOC_014826
TCONS_00029248 lncRNA downstream 349005 26821666 ~ 26823709 (-) True XLOC_014823
TCONS_00030237 lncRNA downstream 365495 26803869 ~ 26807219 (-) True XLOC_014822
TCONS_00029779 lncRNA downstream 384434 26786900 ~ 26788280 (-) True XLOC_014821
TCONS_00029263 lncRNA upstream 140888 27313718 ~ 27314662 (-) False XLOC_014832
TCONS_00029266 lncRNA upstream 160516 27333346 ~ 27334349 (-) False XLOC_014832
TCONS_00029277 lncRNA upstream 280722 27453552 ~ 27462782 (-) False XLOC_014835
TCONS_00030238 lncRNA upstream 280722 27453552 ~ 27463611 (-) False XLOC_014835
TCONS_00030239 lncRNA upstream 291100 27463930 ~ 27469200 (-) False XLOC_014836
TCONS_00029257 mRNA downstream 165950 26967357 ~ 27006764 (-) False XLOC_014829
TCONS_00029256 mRNA downstream 208366 26957425 ~ 26964348 (-) True XLOC_014828
TCONS_00029255 mRNA downstream 228778 26937543 ~ 26943936 (-) True XLOC_014827
TCONS_00029252 mRNA downstream 248757 26869428 ~ 26923957 (-) False XLOC_014826
TCONS_00029253 mRNA downstream 249441 26872685 ~ 26923273 (-) False XLOC_014826
TCONS_00029262 mRNA upstream 110242 27283072 ~ 27315062 (-) False XLOC_014832
TCONS_00029264 mRNA upstream 141107 27313937 ~ 27336092 (-) False XLOC_014832
TCONS_00029265 mRNA upstream 143637 27316467 ~ 27334394 (-) False XLOC_014832
TCONS_00029267 mRNA upstream 161697 27334527 ~ 27339844 (-) False XLOC_014832
TCONS_00029269 mRNA upstream 161700 27334530 ~ 27339670 (-) False XLOC_014832
TCONS_00029249 other downstream 335590 26828181 ~ 26837124 (-) True XLOC_014824
TCONS_00029233 other downstream 1654174 25518420 ~ 25518540 (-) True XLOC_014813
TCONS_00029225 other downstream 2023730 25146786 ~ 25148984 (-) True XLOC_014807
TCONS_00029214 other downstream 2111837 25056812 ~ 25060877 (-) True XLOC_014804
TCONS_00029210 other downstream 2415390 24757193 ~ 24757324 (-) True XLOC_014799
TCONS_00029268 other upstream 161700 27334530 ~ 27336629 (-) False XLOC_014832
TCONS_00029282 other upstream 291586 27464416 ~ 27464482 (-) False XLOC_014836
TCONS_00029285 other upstream 292274 27465104 ~ 27465170 (-) False XLOC_014836
TCONS_00029288 other upstream 292506 27465336 ~ 27465402 (-) False XLOC_014836
TCONS_00029289 other upstream 295619 27468449 ~ 27468515 (-) True XLOC_014836