RNA id: TCONS_00029320


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00029320
length 120
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_014853
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 28441841 ~ 28441960 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GCTGGCAGCTACtgtagctctctgcaactctcacatagctgcccactgaaactaagcagagctgtgcccggtcagtacctggatgagagaccacatgggaaagctaagtTGCTGCTGGAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000115708

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00029786 lncRNA downstream 202784 28237921 ~ 28239057 (-) True XLOC_014850
TCONS_00029785 lncRNA downstream 203053 28237921 ~ 28238788 (-) False XLOC_014850
TCONS_00029312 lncRNA downstream 583826 27856723 ~ 27858015 (-) True XLOC_014847
TCONS_00029784 lncRNA downstream 639284 27802197 ~ 27802557 (-) True XLOC_014845
TCONS_00030256 lncRNA downstream 639297 27801055 ~ 27802544 (-) False XLOC_014845
TCONS_00030258 lncRNA upstream 52013 28493973 ~ 28780408 (-) False XLOC_014854
TCONS_00030259 lncRNA upstream 52013 28493973 ~ 28780408 (-) False XLOC_014854
TCONS_00030257 lncRNA upstream 52013 28493973 ~ 28780408 (-) False XLOC_014854
TCONS_00030260 lncRNA upstream 52013 28493973 ~ 28780411 (-) False XLOC_014854
TCONS_00030261 lncRNA upstream 52013 28493973 ~ 28780414 (-) False XLOC_014854
TCONS_00029319 mRNA downstream 74428 28356753 ~ 28367413 (-) True XLOC_014852
TCONS_00029318 mRNA downstream 81808 28356753 ~ 28360033 (-) False XLOC_014852
TCONS_00029316 mRNA downstream 157964 28281201 ~ 28283877 (-) False XLOC_014851
TCONS_00029317 mRNA downstream 157997 28281537 ~ 28283844 (-) True XLOC_014851
TCONS_00029315 mRNA downstream 311183 28127654 ~ 28130658 (-) True XLOC_014849
TCONS_00029324 mRNA upstream 292088 28734048 ~ 28788466 (-) False XLOC_014854
TCONS_00029325 mRNA upstream 344189 28786149 ~ 28789409 (-) True XLOC_014854
TCONS_00029327 mRNA upstream 832425 29274385 ~ 29294457 (-) False XLOC_014861
TCONS_00029328 mRNA upstream 848361 29290321 ~ 29294457 (-) True XLOC_014861
TCONS_00029329 mRNA upstream 854231 29296191 ~ 29303788 (-) False XLOC_014862
TCONS_00029305 other downstream 836101 27589335 ~ 27605740 (-) True XLOC_014843
TCONS_00029303 other downstream 857104 27581750 ~ 27584737 (-) True XLOC_014841
TCONS_00029297 other downstream 866747 27571706 ~ 27575094 (-) True XLOC_014839
TCONS_00029289 other downstream 973326 27468449 ~ 27468515 (-) True XLOC_014836
TCONS_00029288 other downstream 976439 27465336 ~ 27465402 (-) False XLOC_014836
TCONS_00029333 other upstream 1343135 29785095 ~ 29785212 (-) True XLOC_014865
TCONS_00029339 other upstream 1419899 29861859 ~ 29873115 (-) False XLOC_014868
TCONS_00029343 other upstream 1907343 30349303 ~ 30350198 (-) False XLOC_014872
TCONS_00029352 other upstream 1987372 30429332 ~ 30431750 (-) False XLOC_014875
TCONS_00029367 other upstream 2310849 30752809 ~ 30799963 (-) True XLOC_014881