RNA id: TCONS_00029414


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00029414
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.54
exon number 1
gene id XLOC_014908
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 32649667 ~ 32649781 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GCCagaagctagctctctgcaactctcacatggtcgctcaCTGAAGGTAAGCAGGGCTGaggctggtcagtacctgaatgtgagaccacatgggaagtctagattgctgccggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000183784

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00029413 lncRNA downstream 17529 32624756 ~ 32632138 (-) True XLOC_014907
TCONS_00029371 lncRNA downstream 1684006 30962723 ~ 30965661 (-) True XLOC_014885
TCONS_00029791 lncRNA downstream 1814570 30831190 ~ 30835097 (-) True XLOC_014883
TCONS_00030294 lncRNA downstream 1927163 30721012 ~ 30722504 (-) True XLOC_014880
TCONS_00030293 lncRNA downstream 2025935 30592319 ~ 30623732 (-) True XLOC_014879
TCONS_00029429 lncRNA upstream 608791 33258572 ~ 33268126 (-) False XLOC_014917
TCONS_00029432 lncRNA upstream 620796 33270577 ~ 33274989 (-) True XLOC_014917
TCONS_00030295 lncRNA upstream 1133002 33782783 ~ 33786703 (-) True XLOC_014920
TCONS_00030296 lncRNA upstream 1538411 34188192 ~ 34230285 (-) True XLOC_014927
TCONS_00030297 lncRNA upstream 1632105 34281886 ~ 34283008 (-) True XLOC_014928
TCONS_00029410 mRNA downstream 7942 32622177 ~ 32641725 (-) False XLOC_014907
TCONS_00029409 mRNA downstream 7942 32622177 ~ 32641725 (-) False XLOC_014907
TCONS_00029407 mRNA downstream 48799 32571806 ~ 32600868 (-) False XLOC_014906
TCONS_00029406 mRNA downstream 48844 32571803 ~ 32600823 (-) False XLOC_014906
TCONS_00029408 mRNA downstream 49029 32588891 ~ 32600638 (-) True XLOC_014906
TCONS_00029416 mRNA upstream 116642 32766423 ~ 32804535 (-) False XLOC_014909
TCONS_00029415 mRNA upstream 116642 32766423 ~ 32804535 (-) False XLOC_014909
TCONS_00029417 mRNA upstream 120833 32770614 ~ 32783373 (-) True XLOC_014909
TCONS_00029418 mRNA upstream 190362 32840143 ~ 32849036 (-) True XLOC_014910
TCONS_00029419 mRNA upstream 214796 32864577 ~ 32888758 (-) True XLOC_014911
TCONS_00029412 other downstream 23788 32624756 ~ 32625879 (-) False XLOC_014907
TCONS_00029400 other downstream 319037 32330513 ~ 32330630 (-) True XLOC_014901
TCONS_00029399 other downstream 499556 32078951 ~ 32150111 (-) True XLOC_014900
TCONS_00029389 other downstream 1065266 31583252 ~ 31584401 (-) True XLOC_014894
TCONS_00029381 other downstream 1565694 31080178 ~ 31083973 (-) True XLOC_014888
TCONS_00029434 other upstream 722583 33372364 ~ 33372694 (-) True XLOC_014919
TCONS_00029436 other upstream 1181588 33831369 ~ 33834435 (-) False XLOC_014921
TCONS_00029437 other upstream 1183739 33833520 ~ 33835368 (-) True XLOC_014921
TCONS_00029439 other upstream 1197353 33847134 ~ 33850219 (-) True XLOC_014922
TCONS_00029443 other upstream 1238823 33888604 ~ 33915864 (-) False XLOC_014923