RNA id: TU345409



Basic Information


Item Value
RNA id TU345409
length 586
lncRNA type inter_gene
GC content 0.42
exon number 2
gene id G304237
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 82839051 ~ 82839820 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome
species rainbow trout
(Oncorhynchus mykiss)

Sequence


ctgttagatactactgcactgttggagctaggaacacaagcattttgctacatcaaggatggatggatgtaggaTGTAAGGATGGATGTAGGATGTAGCTGATGGATGTAGGATGTAAGGATGGATGTAGATGATGGATGTAGGATGTAGCTGATGGATGAAGGATGTAGCTGATGGATTTAGGATGGAGGTGATGGATGTAGGATTTAGATGATGGATGTAGGATGTAGTTGATGGATGTAGGATGTAAGAATGGATGTAGGATGGAGATGATGAATGTAGGATGTAGCTGATAGATGTAGGATGTAGATGATGGATGTAGGATGTAGCTGATGGATGTAGGATGGAGATGAGGATGTAGGATGTAGATAATGGATGTAGATGATGGATGTAGATGGTGGATGTAGGATGTAGATGGTGGATGTAGATGGTGGATGTAGGATGTAGATGATGGATGTAGATGATGGATGTAGATGGTGGATGTAGATGGTGGATGTAGATGATGGATGTAGATGATGGATGTAGATGATGGATGTAGATGATGGATGTAGATGGTGGACGTAGGATGTAGATGATGGATGTAGAT

Function


GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU345396 lncRNA downstream 18621 82820149 ~ 82820430 (-) True G304228
TU345387 lncRNA downstream 33953 82803136 ~ 82805098 (-) True G304219
TU345385 lncRNA downstream 35955 82802684 ~ 82803096 (-) True G304218
TU345384 lncRNA downstream 62148 82776613 ~ 82776903 (-) True G304217
TU345262 lncRNA downstream 77643 82760919 ~ 82761408 (-) True G304137
TU345415 lncRNA upstream 60399 82900219 ~ 82900433 (-) True G304243
TU345432 lncRNA upstream 64000 82903820 ~ 82905042 (-) True G304250
TU345422 lncRNA upstream 65853 82905673 ~ 82908040 (-) False LOC110504940
TU345433 lncRNA upstream 69700 82909520 ~ 82909899 (-) True G304251
TU345439 lncRNA upstream 83823 82923643 ~ 82923878 (-) True G304257
XM_021584685.2 mRNA downstream 91317 82744854 ~ 82747734 (-) False LOC110505453
XM_036975335.1 mRNA downstream 252969 82297732 ~ 82586082 (-) False pard3bb
XM_036965260.1 mRNA upstream 65666 82905486 ~ 83193706 (-) False LOC110504940
XM_036975345.1 mRNA upstream 643633 83483453 ~ 83539175 (-) False ttll4
XM_036975348.1 mRNA upstream 643633 83483453 ~ 83539354 (-) False ttll4
XM_036975344.1 mRNA upstream 643633 83483453 ~ 83539355 (-) False ttll4
XM_036975346.1 mRNA upstream 643633 83483453 ~ 83539355 (-) False ttll4
TU345254 other downstream 91313 82745244 ~ 82747738 (-) True LOC110505453
TU344968 other downstream 524970 82297756 ~ 82314081 (-) True pard3bb
TU344667 other downstream 815600 82022829 ~ 82023451 (-) True G303665
TU344665 other downstream 816786 82021388 ~ 82022265 (-) True G303663
TU343486 other downstream 2116428 80721738 ~ 80722623 (-) True G302725
TU345446 other upstream 110249 82950069 ~ 82951356 (-) True G304264
TU346425 other upstream 1115924 83955744 ~ 83986517 (-) True abi2a
TU346535 other upstream 1240201 84080021 ~ 84080484 (-) True LOC110504983
TU346587 other upstream 1341231 84181051 ~ 84182035 (-) True G305189
TU346768 other upstream 1441663 84281483 ~ 84300976 (-) True si:dkey-230p4.1

Expression Profile