RNA id: TCONS_00030536


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00030536
length 72
RNA type snoRNA
GC content 0.44
exon number 1
gene id XLOC_015217
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 7723870 ~ 7723941 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GTATGAAGTGATGCACGTCATCTTTCGGGACTGACCTCTCATGGAGAGAACATTTCGACTTACTGATCATAC

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000117487

JBrowse2

Loading

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00030530 lncRNA upstream 543 7715806 ~ 7723327 (+) False XLOC_015213
TCONS_00033473 lncRNA upstream 3157 7715792 ~ 7720713 (+) False XLOC_015213
TCONS_00033237 lncRNA upstream 61769 7657408 ~ 7662101 (+) True XLOC_015212
TCONS_00033472 lncRNA upstream 62372 7657298 ~ 7661498 (+) False XLOC_015212
TCONS_00033236 lncRNA upstream 69252 7647863 ~ 7654618 (+) True XLOC_015211
TCONS_00033474 lncRNA downstream 39966 7763907 ~ 7768273 (+) False XLOC_015218
TCONS_00033475 lncRNA downstream 39970 7763911 ~ 7768273 (+) True XLOC_015218
TCONS_00033476 lncRNA downstream 760453 8484394 ~ 8488138 (+) False XLOC_015225
TCONS_00033238 lncRNA downstream 761070 8485011 ~ 8488138 (+) False XLOC_015225
TCONS_00033239 lncRNA downstream 761099 8485040 ~ 8488138 (+) False XLOC_015225
TCONS_00030529 mRNA upstream 136210 7557912 ~ 7587660 (+) True XLOC_015209
TCONS_00030527 mRNA upstream 311289 7295515 ~ 7412581 (+) False XLOC_015205
TCONS_00030526 mRNA upstream 437561 7279646 ~ 7286309 (+) True XLOC_015204
TCONS_00030524 mRNA upstream 487576 7213146 ~ 7236294 (+) False XLOC_015202
TCONS_00030537 mRNA downstream 94427 7818368 ~ 7829400 (+) True XLOC_015219
TCONS_00030538 mRNA downstream 123539 7847480 ~ 7874075 (+) False XLOC_015220
TCONS_00030539 mRNA downstream 125949 7849890 ~ 7869613 (+) False XLOC_015220
TCONS_00030540 mRNA downstream 127552 7851493 ~ 7874384 (+) True XLOC_015220
TCONS_00030541 mRNA downstream 307293 8031234 ~ 8050498 (+) False XLOC_015221
TCONS_00030535 other upstream 287 7723394 ~ 7723583 (+) True XLOC_015216
TCONS_00030534 other upstream 2480 7721212 ~ 7721390 (+) True XLOC_015215
TCONS_00030533 other upstream 2861 7720939 ~ 7721009 (+) True XLOC_015214
TCONS_00030532 other upstream 3241 7720559 ~ 7720629 (+) True XLOC_015213
TCONS_00030528 other upstream 328962 7394790 ~ 7394908 (+) True XLOC_015206
TCONS_00030543 other downstream 321475 8045416 ~ 8047257 (+) True XLOC_015221
TCONS_00030545 other downstream 465344 8189285 ~ 8189400 (+) True XLOC_015223
TCONS_00030568 other downstream 2107397 9831338 ~ 9833806 (+) False XLOC_015238
TCONS_00030569 other downstream 2114091 9838032 ~ 9841864 (+) False XLOC_015238
TCONS_00030571 other downstream 2151588 9875529 ~ 9875645 (+) True XLOC_015239