RNA id: TCONS_00030557


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00030557
length 186
RNA type mRNA
GC content 0.34
exon number 8
gene id XLOC_015233
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 9536021 ~ 9558915 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

gatcaaaatgaatcaaaaaATATTGGTTTAAAAGttataataaatatatttaaaaAAATGGATGCCGTGTGCTCtcgaccaaagaagaaaaggatcatccagactatTACCAGCGACATTTCCAAAAGCCAGggttgggCACAATTTCTAATCCATTACTGCATTCATCCATCTGAAaatgttgga

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000187357

JBrowse2

Loading

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00033478 lncRNA upstream 205812 9132585 ~ 9330209 (+) True XLOC_015231
TCONS_00033479 lncRNA upstream 217742 9316319 ~ 9318279 (+) True XLOC_015232
TCONS_00030555 lncRNA upstream 710635 8814239 ~ 8825386 (+) True XLOC_015229
TCONS_00033241 lncRNA upstream 844992 8690658 ~ 8691029 (+) True XLOC_015227
TCONS_00033239 lncRNA upstream 1047883 8485040 ~ 8488138 (+) False XLOC_015225
TCONS_00033480 lncRNA downstream 92801 9651716 ~ 9657047 (+) False XLOC_015236
TCONS_00033481 lncRNA downstream 93085 9652000 ~ 9657047 (+) False XLOC_015236
TCONS_00033483 lncRNA downstream 93438 9652353 ~ 9657047 (+) False XLOC_015236
TCONS_00033482 lncRNA downstream 93438 9652353 ~ 9657047 (+) False XLOC_015236
TCONS_00033485 lncRNA downstream 93467 9652382 ~ 9657047 (+) False XLOC_015236
TCONS_00030556 mRNA upstream 397524 9061885 ~ 9138497 (+) True XLOC_015230
TCONS_00030552 mRNA upstream 693549 8778490 ~ 8842472 (+) False XLOC_015229
TCONS_00030554 mRNA upstream 695125 8780443 ~ 8840896 (+) False XLOC_015229
TCONS_00030553 mRNA upstream 729119 8779164 ~ 8806902 (+) False XLOC_015229
TCONS_00030549 mRNA upstream 758525 8717155 ~ 8777496 (+) False XLOC_015228
TCONS_00030559 mRNA downstream 1825 9560740 ~ 9590850 (+) True XLOC_015235
TCONS_00030560 mRNA downstream 196507 9755422 ~ 9779959 (+) False XLOC_015237
TCONS_00030561 mRNA downstream 198538 9757453 ~ 9779523 (+) True XLOC_015237
TCONS_00030562 mRNA downstream 262842 9821757 ~ 9842240 (+) False XLOC_015238
TCONS_00030563 mRNA downstream 262855 9821770 ~ 9841522 (+) False XLOC_015238
TCONS_00030545 other upstream 1346621 8189285 ~ 8189400 (+) True XLOC_015223
TCONS_00030543 other upstream 1488764 8045416 ~ 8047257 (+) True XLOC_015221
TCONS_00030536 other upstream 1812080 7723870 ~ 7723941 (+) True XLOC_015217
TCONS_00030535 other upstream 1812438 7723394 ~ 7723583 (+) True XLOC_015216
TCONS_00030534 other upstream 1814631 7721212 ~ 7721390 (+) True XLOC_015215
TCONS_00030568 other downstream 272423 9831338 ~ 9833806 (+) False XLOC_015238
TCONS_00030569 other downstream 279117 9838032 ~ 9841864 (+) False XLOC_015238
TCONS_00030571 other downstream 316614 9875529 ~ 9875645 (+) True XLOC_015239
TCONS_00030577 other downstream 414966 9973881 ~ 9982953 (+) True XLOC_015242
TCONS_00030590 other downstream 647086 10206001 ~ 10206118 (+) True XLOC_015249