RNA id: TCONS_00030605


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00030605
length 134
RNA type rRNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_015261
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 11006657 ~ 11006790 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TTCAACTGTGAAAGCAATGAATCACTCTCGACCTGTGAATACAGACAACTGAGTGCTTACAGCTGAATCACTGAGCCTGGCCTGgacagtacctggatgggagaccacatgggaaaactaggttgcggATGGAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000119295

JBrowse2

Loading

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00033489 lncRNA upstream 399328 10604513 ~ 10607329 (+) True XLOC_015254
TCONS_00033488 lncRNA upstream 442271 10563499 ~ 10564386 (+) True XLOC_015253
TCONS_00030592 lncRNA upstream 590385 10386479 ~ 10416272 (+) True XLOC_015252
TCONS_00033487 lncRNA upstream 721028 10284761 ~ 10285629 (+) True XLOC_015251
TCONS_00030570 lncRNA upstream 1168008 9838071 ~ 9838649 (+) True XLOC_015238
TCONS_00030612 lncRNA downstream 48526 11055316 ~ 11063844 (+) True XLOC_015262
TCONS_00030616 lncRNA downstream 201673 11208463 ~ 11209682 (+) True XLOC_015264
TCONS_00033490 lncRNA downstream 622212 11629002 ~ 11633323 (+) False XLOC_015266
TCONS_00033491 lncRNA downstream 622221 11629011 ~ 11633323 (+) False XLOC_015266
TCONS_00033492 lncRNA downstream 622253 11629043 ~ 11633323 (+) True XLOC_015266
TCONS_00030604 mRNA upstream 74887 10914023 ~ 10931770 (+) True XLOC_015260
TCONS_00030603 mRNA upstream 126108 10878406 ~ 10880549 (+) True XLOC_015259
TCONS_00030599 mRNA upstream 148759 10821127 ~ 10857898 (+) False XLOC_015258
TCONS_00030601 mRNA upstream 148760 10821154 ~ 10857897 (+) False XLOC_015258
TCONS_00030600 mRNA upstream 148760 10821154 ~ 10857897 (+) False XLOC_015258
TCONS_00030606 mRNA downstream 22133 11028923 ~ 11063679 (+) False XLOC_015262
TCONS_00030607 mRNA downstream 22348 11029138 ~ 11039033 (+) False XLOC_015262
TCONS_00030608 mRNA downstream 22348 11029138 ~ 11063878 (+) False XLOC_015262
TCONS_00030609 mRNA downstream 22354 11029144 ~ 11048165 (+) False XLOC_015262
TCONS_00030610 mRNA downstream 24570 11031360 ~ 11063683 (+) False XLOC_015262
TCONS_00030590 other upstream 800539 10206001 ~ 10206118 (+) True XLOC_015249
TCONS_00030577 other upstream 1023704 9973881 ~ 9982953 (+) True XLOC_015242
TCONS_00030571 other upstream 1131012 9875529 ~ 9875645 (+) True XLOC_015239
TCONS_00030569 other upstream 1164793 9838032 ~ 9841864 (+) False XLOC_015238
TCONS_00030568 other upstream 1172851 9831338 ~ 9833806 (+) False XLOC_015238
TCONS_00030617 other downstream 237096 11243886 ~ 11244007 (+) True XLOC_015265
TCONS_00030621 other downstream 750134 11756924 ~ 11764998 (+) False XLOC_015269
TCONS_00030632 other downstream 1370032 12376822 ~ 12378603 (+) False XLOC_015273
TCONS_00030633 other downstream 1387833 12394623 ~ 12394983 (+) False XLOC_015273
TCONS_00030634 other downstream 1394465 12401255 ~ 12404031 (+) True XLOC_015273