RNA id: TCONS_00030617


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00030617
length 122
RNA type rRNA
GC content 0.45
exon number 1
gene id XLOC_015265
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 11243886 ~ 11244007 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TCCAGGATCACATAAACAACCCAAATTCTGAATTTGGGTTGTGAattctgaagctaagcagggctgagcctgttcagtacctggatgggagaccactagggaataCTAGGTAGctattggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000120312

JBrowse2

Loading

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00030616 lncRNA upstream 34204 11208463 ~ 11209682 (+) True XLOC_015264
TCONS_00030612 lncRNA upstream 180042 11055316 ~ 11063844 (+) True XLOC_015262
TCONS_00033489 lncRNA upstream 636557 10604513 ~ 10607329 (+) True XLOC_015254
TCONS_00033488 lncRNA upstream 679500 10563499 ~ 10564386 (+) True XLOC_015253
TCONS_00030592 lncRNA upstream 827614 10386479 ~ 10416272 (+) True XLOC_015252
TCONS_00033490 lncRNA downstream 384995 11629002 ~ 11633323 (+) False XLOC_015266
TCONS_00033491 lncRNA downstream 385004 11629011 ~ 11633323 (+) False XLOC_015266
TCONS_00033492 lncRNA downstream 385036 11629043 ~ 11633323 (+) True XLOC_015266
TCONS_00030618 lncRNA downstream 404156 11648163 ~ 11648838 (+) True XLOC_015267
TCONS_00033493 lncRNA downstream 1391920 12635927 ~ 12637877 (+) True XLOC_015274
TCONS_00030614 mRNA upstream 33718 11205795 ~ 11210168 (+) False XLOC_015264
TCONS_00030615 mRNA upstream 35138 11206317 ~ 11208748 (+) False XLOC_015264
TCONS_00030613 mRNA upstream 117665 11119315 ~ 11126221 (+) True XLOC_015263
TCONS_00030608 mRNA upstream 180008 11029138 ~ 11063878 (+) False XLOC_015262
TCONS_00030610 mRNA upstream 180203 11031360 ~ 11063683 (+) False XLOC_015262
TCONS_00030619 mRNA downstream 426263 11670270 ~ 11677705 (+) True XLOC_015268
TCONS_00030620 mRNA downstream 441735 11685742 ~ 11833284 (+) False XLOC_015269
TCONS_00030622 mRNA downstream 516541 11760548 ~ 11833356 (+) True XLOC_015269
TCONS_00030623 mRNA downstream 679608 11923615 ~ 11945936 (+) False XLOC_015270
TCONS_00030624 mRNA downstream 679817 11923824 ~ 11944959 (+) True XLOC_015270
TCONS_00030605 other upstream 237096 11006657 ~ 11006790 (+) True XLOC_015261
TCONS_00030590 other upstream 1037768 10206001 ~ 10206118 (+) True XLOC_015249
TCONS_00030577 other upstream 1260933 9973881 ~ 9982953 (+) True XLOC_015242
TCONS_00030571 other upstream 1368241 9875529 ~ 9875645 (+) True XLOC_015239
TCONS_00030569 other upstream 1402022 9838032 ~ 9841864 (+) False XLOC_015238
TCONS_00030621 other downstream 512917 11756924 ~ 11764998 (+) False XLOC_015269
TCONS_00030632 other downstream 1132815 12376822 ~ 12378603 (+) False XLOC_015273
TCONS_00030633 other downstream 1150616 12394623 ~ 12394983 (+) False XLOC_015273
TCONS_00030634 other downstream 1157248 12401255 ~ 12404031 (+) True XLOC_015273
TCONS_00030641 other downstream 1879559 13123566 ~ 13123682 (+) True XLOC_015279