RNA id: TCONS_00030653



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00030653
length 191
RNA type snRNA
GC content 0.48
exon number 1
gene id XLOC_015293
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 14675795 ~ 14675985 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ATCGCTTCTCGGCCTTTTGGCTAAGATCAAGTGTAGTATCTGTTCTTATCAGTTTAATATCTGATACGTGCCCTACCCGGGCACTATATATTAAATTGATTTTTGCAGCTGGGAGATGGGTTAGGGGCTTGCTCCACCCACTCCACGCATCGACCTGGTATTGCAGTACCTCCGGGAACGGTGCACTCATT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000116257

JBrowse2


Loading

Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00033502 lncRNA upstream 169173 14502058 ~ 14506622 (+) False XLOC_015289
TCONS_00033503 lncRNA upstream 169173 14502116 ~ 14506622 (+) False XLOC_015289
TCONS_00033504 lncRNA upstream 169173 14502294 ~ 14506622 (+) False XLOC_015289
TCONS_00033505 lncRNA upstream 169173 14502387 ~ 14506622 (+) False XLOC_015289
TCONS_00033245 lncRNA upstream 171078 14503216 ~ 14504717 (+) True XLOC_015289
TCONS_00033246 lncRNA downstream 114818 14790803 ~ 14791132 (+) True XLOC_015298
TCONS_00033247 lncRNA downstream 261209 14937194 ~ 14937494 (+) True XLOC_015299
TCONS_00033506 lncRNA downstream 278334 14954319 ~ 14961793 (+) False XLOC_015300
TCONS_00033248 lncRNA downstream 285449 14961434 ~ 14965046 (+) True XLOC_015300
TCONS_00033507 lncRNA downstream 795698 15471683 ~ 15480725 (+) True XLOC_015308
TCONS_00030649 mRNA upstream 734878 13907452 ~ 13940917 (+) True XLOC_015284
TCONS_00030647 mRNA upstream 875199 13721888 ~ 13800596 (+) False XLOC_015283
TCONS_00030648 mRNA upstream 887723 13722116 ~ 13788072 (+) True XLOC_015283
TCONS_00030644 mRNA upstream 954646 13694450 ~ 13721149 (+) False XLOC_015282
TCONS_00030659 mRNA downstream 316894 14992879 ~ 14995050 (+) True XLOC_015302
TCONS_00030660 mRNA downstream 372425 15048410 ~ 15075295 (+) False XLOC_015303
TCONS_00030661 mRNA downstream 393026 15069011 ~ 15075293 (+) True XLOC_015303
TCONS_00030662 mRNA downstream 424757 15100742 ~ 15106968 (+) True XLOC_015304
TCONS_00030663 mRNA downstream 452042 15128027 ~ 15198117 (+) False XLOC_015305
TCONS_00030652 other upstream 4622 14670997 ~ 14671173 (+) True XLOC_015292
TCONS_00030651 other upstream 10442 14665168 ~ 14665353 (+) True XLOC_015291
TCONS_00030650 other upstream 15249 14660356 ~ 14660546 (+) True XLOC_015290
TCONS_00030641 other upstream 1552113 13123566 ~ 13123682 (+) True XLOC_015279
TCONS_00030634 other upstream 2271764 12401255 ~ 12404031 (+) True XLOC_015273
TCONS_00030654 other downstream 37409 14713394 ~ 14713538 (+) True XLOC_015294
TCONS_00030655 other downstream 48975 14724960 ~ 14725146 (+) True XLOC_015295
TCONS_00030656 other downstream 91492 14767477 ~ 14767626 (+) True XLOC_015296
TCONS_00030657 other downstream 103119 14779104 ~ 14780075 (+) True XLOC_015297
TCONS_00030658 other downstream 294022 14970007 ~ 14971019 (+) True XLOC_015301