RNA id: TCONS_00030655



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00030655
length 187
RNA type snRNA
GC content 0.44
exon number 1
gene id XLOC_015295
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 14724960 ~ 14725146 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


aacgctgtcaataaattttttttcgaAAGAAAAATCTGTTCTTATCAGTTTAATATCTGATACGTGCCCTACCCGGGCACTATATATTAAATTGATTTTTGCAGCTGGGAGATGGGTTAGGGGCTTGCTCCACCCACTCCACGCATCGACCTGGTATTGCAGTACCTCCGGGAACGGTGCACTCATT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000118410

JBrowse2


Loading

Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00033502 lncRNA upstream 218338 14502058 ~ 14506622 (+) False XLOC_015289
TCONS_00033503 lncRNA upstream 218338 14502116 ~ 14506622 (+) False XLOC_015289
TCONS_00033504 lncRNA upstream 218338 14502294 ~ 14506622 (+) False XLOC_015289
TCONS_00033505 lncRNA upstream 218338 14502387 ~ 14506622 (+) False XLOC_015289
TCONS_00033245 lncRNA upstream 220243 14503216 ~ 14504717 (+) True XLOC_015289
TCONS_00033246 lncRNA downstream 65657 14790803 ~ 14791132 (+) True XLOC_015298
TCONS_00033247 lncRNA downstream 212048 14937194 ~ 14937494 (+) True XLOC_015299
TCONS_00033506 lncRNA downstream 229173 14954319 ~ 14961793 (+) False XLOC_015300
TCONS_00033248 lncRNA downstream 236288 14961434 ~ 14965046 (+) True XLOC_015300
TCONS_00033507 lncRNA downstream 746537 15471683 ~ 15480725 (+) True XLOC_015308
TCONS_00030649 mRNA upstream 784043 13907452 ~ 13940917 (+) True XLOC_015284
TCONS_00030647 mRNA upstream 924364 13721888 ~ 13800596 (+) False XLOC_015283
TCONS_00030648 mRNA upstream 936888 13722116 ~ 13788072 (+) True XLOC_015283
TCONS_00030644 mRNA upstream 1003811 13694450 ~ 13721149 (+) False XLOC_015282
TCONS_00030659 mRNA downstream 267733 14992879 ~ 14995050 (+) True XLOC_015302
TCONS_00030660 mRNA downstream 323264 15048410 ~ 15075295 (+) False XLOC_015303
TCONS_00030661 mRNA downstream 343865 15069011 ~ 15075293 (+) True XLOC_015303
TCONS_00030662 mRNA downstream 375596 15100742 ~ 15106968 (+) True XLOC_015304
TCONS_00030663 mRNA downstream 402881 15128027 ~ 15198117 (+) False XLOC_015305
TCONS_00030654 other upstream 11422 14713394 ~ 14713538 (+) True XLOC_015294
TCONS_00030653 other upstream 48975 14675795 ~ 14675985 (+) True XLOC_015293
TCONS_00030652 other upstream 53787 14670997 ~ 14671173 (+) True XLOC_015292
TCONS_00030651 other upstream 59607 14665168 ~ 14665353 (+) True XLOC_015291
TCONS_00030650 other upstream 64414 14660356 ~ 14660546 (+) True XLOC_015290
TCONS_00030656 other downstream 42331 14767477 ~ 14767626 (+) True XLOC_015296
TCONS_00030657 other downstream 53958 14779104 ~ 14780075 (+) True XLOC_015297
TCONS_00030658 other downstream 244861 14970007 ~ 14971019 (+) True XLOC_015301
TCONS_00030665 other downstream 448121 15173267 ~ 15173383 (+) True XLOC_015306
TCONS_00030675 other downstream 1143279 15868425 ~ 15868540 (+) True XLOC_015313