RNA id: TCONS_00030675


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00030675
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.48
exon number 1
gene id XLOC_015313
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 15868425 ~ 15868540 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

gccacagccatatcaccctacaTTTCAAGAACAGTTACttattgaagctaagcagggctaagcctggtcagtacctggatgggagaccacatgggaaaactaggttgctgctggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000185746

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00030674 lncRNA upstream 24389 15833553 ~ 15844036 (+) True XLOC_015312
TCONS_00030670 lncRNA upstream 241458 15623693 ~ 15626967 (+) True XLOC_015310
TCONS_00033507 lncRNA upstream 387700 15471683 ~ 15480725 (+) True XLOC_015308
TCONS_00033248 lncRNA upstream 903379 14961434 ~ 14965046 (+) True XLOC_015300
TCONS_00033506 lncRNA upstream 906632 14954319 ~ 14961793 (+) False XLOC_015300
TCONS_00030678 lncRNA downstream 292442 16160982 ~ 16166102 (+) True XLOC_015314
TCONS_00030683 lncRNA downstream 308875 16177415 ~ 16191890 (+) False XLOC_015315
TCONS_00030684 lncRNA downstream 319954 16188494 ~ 16191380 (+) False XLOC_015315
TCONS_00033249 lncRNA downstream 658658 16527198 ~ 16528680 (+) True XLOC_015320
TCONS_00030699 lncRNA downstream 842343 16710883 ~ 16724646 (+) False XLOC_015326
TCONS_00030669 mRNA upstream 241453 15612755 ~ 15626972 (+) False XLOC_015310
TCONS_00030668 mRNA upstream 278434 15586632 ~ 15589991 (+) True XLOC_015309
TCONS_00030666 mRNA upstream 573718 15203322 ~ 15294707 (+) False XLOC_015307
TCONS_00030667 mRNA upstream 574063 15209676 ~ 15294362 (+) True XLOC_015307
TCONS_00030663 mRNA upstream 670308 15128027 ~ 15198117 (+) False XLOC_015305
TCONS_00030676 mRNA downstream 292366 16160906 ~ 16172257 (+) False XLOC_015314
TCONS_00030681 mRNA downstream 305459 16173999 ~ 16193890 (+) False XLOC_015315
TCONS_00030680 mRNA downstream 305459 16173999 ~ 16193890 (+) False XLOC_015315
TCONS_00030679 mRNA downstream 305459 16173999 ~ 16193890 (+) False XLOC_015315
TCONS_00030682 mRNA downstream 305506 16174046 ~ 16194196 (+) False XLOC_015315
TCONS_00030665 other upstream 695042 15173267 ~ 15173383 (+) True XLOC_015306
TCONS_00030658 other upstream 897406 14970007 ~ 14971019 (+) True XLOC_015301
TCONS_00030657 other upstream 1088350 14779104 ~ 14780075 (+) True XLOC_015297
TCONS_00030656 other upstream 1100799 14767477 ~ 14767626 (+) True XLOC_015296
TCONS_00030655 other upstream 1143279 14724960 ~ 14725146 (+) True XLOC_015295
TCONS_00030677 other downstream 292403 16160943 ~ 16161569 (+) False XLOC_015314
TCONS_00030714 other downstream 956219 16824759 ~ 16824819 (+) True XLOC_015329
TCONS_00030715 other downstream 961149 16829689 ~ 16829764 (+) True XLOC_015330
TCONS_00030726 other downstream 1789418 17657958 ~ 17658076 (+) True XLOC_015342
TCONS_00030730 other downstream 2633768 18502308 ~ 18502424 (+) True XLOC_015347

Expression Profile

//