RNA id: TCONS_00030864



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00030864
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_015426
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 23679873 ~ 23679989 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


AGCCacagtcatatcaccctgcagcccaagactggttactcactgaagctaaagAGGGCTGAGCCTGGACAGTACCTGGATgtgagatcacatgggaaaactaggtagCTGTTGGAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000181047

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00030862 lncRNA upstream 59650 23613106 ~ 23620223 (+) True XLOC_015424
TCONS_00033533 lncRNA upstream 70597 23541727 ~ 23609276 (+) False XLOC_015422
TCONS_00033534 lncRNA upstream 70597 23544273 ~ 23609276 (+) False XLOC_015422
TCONS_00033536 lncRNA upstream 70597 23576001 ~ 23609276 (+) True XLOC_015422
TCONS_00033535 lncRNA upstream 122358 23550186 ~ 23557515 (+) True XLOC_015423
TCONS_00033537 lncRNA downstream 92929 23772918 ~ 23779429 (+) True XLOC_015428
TCONS_00033538 lncRNA downstream 256546 23936535 ~ 23940330 (+) True XLOC_015432
TCONS_00033539 lncRNA downstream 342809 24022798 ~ 24024448 (+) True XLOC_015434
TCONS_00030881 lncRNA downstream 581228 24261217 ~ 24261296 (+) True XLOC_015437
TCONS_00033540 lncRNA downstream 804284 24484273 ~ 24488154 (+) False XLOC_015443
TCONS_00030861 mRNA upstream 59654 23613040 ~ 23620219 (+) False XLOC_015424
TCONS_00030860 mRNA upstream 195525 23482798 ~ 23484348 (+) True XLOC_015421
TCONS_00030857 mRNA upstream 317940 23351454 ~ 23361933 (+) False XLOC_015417
TCONS_00030859 mRNA upstream 318864 23352302 ~ 23361009 (+) True XLOC_015417
TCONS_00030858 mRNA upstream 324168 23351533 ~ 23355705 (+) False XLOC_015417
TCONS_00030865 mRNA downstream 21624 23701613 ~ 23726605 (+) True XLOC_015425
TCONS_00030866 mRNA downstream 51205 23731194 ~ 23745290 (+) True XLOC_015427
TCONS_00030867 mRNA downstream 110759 23790748 ~ 23805139 (+) True XLOC_015429
TCONS_00030868 mRNA downstream 128651 23808640 ~ 23820280 (+) True XLOC_015430
TCONS_00030869 mRNA downstream 143633 23823622 ~ 23837423 (+) True XLOC_015431
TCONS_00030856 other upstream 405092 23274332 ~ 23274781 (+) True XLOC_015415
TCONS_00030855 other upstream 421976 23257777 ~ 23257897 (+) True XLOC_015416
TCONS_00030841 other upstream 688352 22986282 ~ 22991521 (+) True XLOC_015408
TCONS_00030832 other upstream 1013173 22660071 ~ 22666700 (+) True XLOC_015401
TCONS_00030805 other upstream 2304279 21375467 ~ 21375594 (+) True XLOC_015384
TCONS_00030870 other downstream 333261 24013250 ~ 24014943 (+) True XLOC_015433
TCONS_00030885 other downstream 668600 24348589 ~ 24351040 (+) True XLOC_015440
TCONS_00030891 other downstream 804300 24484289 ~ 24497841 (+) True XLOC_015443
TCONS_00030897 other downstream 860058 24540047 ~ 24540765 (+) False XLOC_015445
TCONS_00030898 other downstream 860220 24540209 ~ 24540725 (+) True XLOC_015445

Expression Profile


//