RNA id: TCONS_00030870



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00030870
length 440
RNA type processed_transcript
GC content 0.48
exon number 2
gene id XLOC_015433
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 24013250 ~ 24014943 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ACGGCGCTCCGGACTGCTGAAATCCGACCCCAAAAAATCTCCGAGAAGCGACGCTCTCGACTCTTTCAAATCCGTTTTAGAGCAGTGACCCCATAAACAACTCGCCTGTTCAATCCttcaacaaatatatttttttatcatccTTGGCTGTGAGTTGCATCACATGGCGGTGAGAGGCTTTTTTTTAGAAGAGCACATGCTTGGGGACAAAAGGCTGTGAAAACGAAGAATCCCTGTGCCATACTGAGCAAACTCCTGAGAGACCTATTTAAAGCACTGAAAATAACGTCCACGAAGGACCACCCGGGAGGTAAGAGCCTTGTTTGACTTTCACCAGGGGGCTTTTAGACCCCATACTGTCCCCTCACAGACTTACAGAGCCGCCTCAAGGCACTCGTACCTCTCTATGAAACAATGCAACAAATCAGGGGCATAGATCC

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000135803

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00033538 lncRNA upstream 72920 23936535 ~ 23940330 (+) True XLOC_015432
TCONS_00033537 lncRNA upstream 233821 23772918 ~ 23779429 (+) True XLOC_015428
TCONS_00030862 lncRNA upstream 393027 23613106 ~ 23620223 (+) True XLOC_015424
TCONS_00033533 lncRNA upstream 403974 23541727 ~ 23609276 (+) False XLOC_015422
TCONS_00033539 lncRNA downstream 7855 24022798 ~ 24024448 (+) True XLOC_015434
TCONS_00030881 lncRNA downstream 246274 24261217 ~ 24261296 (+) True XLOC_015437
TCONS_00033540 lncRNA downstream 469330 24484273 ~ 24488154 (+) False XLOC_015443
TCONS_00030890 lncRNA downstream 469332 24484275 ~ 24488154 (+) False XLOC_015443
TCONS_00030894 lncRNA downstream 492827 24507770 ~ 24509698 (+) False XLOC_015444
TCONS_00030869 mRNA upstream 175827 23823622 ~ 23837423 (+) True XLOC_015431
TCONS_00030868 mRNA upstream 192970 23808640 ~ 23820280 (+) True XLOC_015430
TCONS_00030867 mRNA upstream 208111 23790748 ~ 23805139 (+) True XLOC_015429
TCONS_00030866 mRNA upstream 267960 23731194 ~ 23745290 (+) True XLOC_015427
TCONS_00030865 mRNA upstream 286645 23701613 ~ 23726605 (+) True XLOC_015425
TCONS_00030871 mRNA downstream 65751 24080694 ~ 24168670 (+) False XLOC_015435
TCONS_00030872 mRNA downstream 66107 24081050 ~ 24165596 (+) True XLOC_015435
TCONS_00030873 mRNA downstream 162063 24177006 ~ 24252336 (+) False XLOC_015436
TCONS_00030874 mRNA downstream 162247 24177190 ~ 24222094 (+) False XLOC_015436
TCONS_00030877 mRNA downstream 173559 24188502 ~ 24252506 (+) False XLOC_015436
TCONS_00030864 other upstream 333261 23679873 ~ 23679989 (+) True XLOC_015426
TCONS_00030856 other upstream 738469 23274332 ~ 23274781 (+) True XLOC_015415
TCONS_00030855 other upstream 755353 23257777 ~ 23257897 (+) True XLOC_015416
TCONS_00030841 other upstream 1021729 22986282 ~ 22991521 (+) True XLOC_015408
TCONS_00030832 other upstream 1346550 22660071 ~ 22666700 (+) True XLOC_015401
TCONS_00030885 other downstream 333646 24348589 ~ 24351040 (+) True XLOC_015440
TCONS_00030891 other downstream 469346 24484289 ~ 24497841 (+) True XLOC_015443
TCONS_00030897 other downstream 525104 24540047 ~ 24540765 (+) False XLOC_015445
TCONS_00030898 other downstream 525266 24540209 ~ 24540725 (+) True XLOC_015445
TCONS_00030908 other downstream 827644 24842587 ~ 24845999 (+) True XLOC_015452