RNA id: XM_021603435.2


Basic Information

Item Value
RNA id XM_021603435.2
length 11006
RNA type mRNA
GC content 0.46
exon number 18
gene id rc3h1a
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 56658921 ~ 56688589 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome
species rainbow trout
(Oncorhynchus mykiss)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG:

id description
K15690 RC3H; RING finger and CCCH-type zinc finger domain-containing protein

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU473861 lncRNA upstream 42068 56614206 ~ 56616854 (+) True G418076
TU473847 lncRNA upstream 64556 56593978 ~ 56594366 (+) True G418063
TU473780 lncRNA upstream 180356 56477763 ~ 56478566 (+) False G418007
TU473781 lncRNA upstream 180356 56478117 ~ 56478566 (+) True G418007
TU473760 lncRNA upstream 185787 56471045 ~ 56473135 (+) True G417989
TU473972 lncRNA downstream 137550 56826139 ~ 56826512 (+) True G418176
TU473974 lncRNA downstream 139082 56827671 ~ 56827880 (+) True G418178
TU473977 lncRNA downstream 141133 56829722 ~ 56829961 (+) True G418181
TU473979 lncRNA downstream 144787 56833376 ~ 56833580 (+) True G418183
TU473980 lncRNA downstream 145048 56833637 ~ 56833862 (+) True G418184
XM_021603431.2 mRNA upstream 11832 56631796 ~ 56647090 (+) False stil
XM_021603432.2 mRNA upstream 11832 56631796 ~ 56647090 (+) False stil
XM_021603433.2 mRNA upstream 11832 56631796 ~ 56647090 (+) False stil
XM_021603434.2 mRNA upstream 11832 56631796 ~ 56647090 (+) True stil
XM_021603426.2 mRNA upstream 65641 56585697 ~ 56593281 (+) True LOC110524094
XM_021603437.2 mRNA downstream 8029 56696618 ~ 56702156 (+) False serpinc1
XM_021603438.2 mRNA downstream 8048 56696637 ~ 56702156 (+) True serpinc1
XM_021603443.2 mRNA downstream 91269 56779858 ~ 56788653 (+) True dph5
NM_001124203.1 mRNA downstream 255254 56943843 ~ 56956322 (+) False LOC100135807
XR_005051970.1 mRNA downstream 266735 56955324 ~ 56955462 (+) True LOC118964777
TU473866 other upstream 30305 56617890 ~ 56628617 (+) True G418077
TU472519 other upstream 1333651 55324645 ~ 55325271 (+) True G416857
TU471439 other upstream 2045780 54590074 ~ 54613142 (+) False G415946
TU471449 other upstream 2045780 54590074 ~ 54613142 (+) False G415946
TU471274 other upstream 2308307 54346536 ~ 54350615 (+) False mutyh
TU473915 other downstream 37596 56726185 ~ 56729821 (+) True G418119
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TU474030 other downstream 255249 56943838 ~ 56958165 (+) True LOC100135807
TU475029 other downstream 676775 57365364 ~ 57367337 (+) True LOC110524119
TU475377 other downstream 1195791 57884380 ~ 57899648 (+) True G419452

Expression Profile