RNA id: TCONS_00031219



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00031219
length 60
RNA type unprocessed_pseudogene
GC content 0.40
exon number 1
gene id XLOC_015646
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 36098969 ~ 36099028 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TGACTACCGGTTAATTGAAGATGATATTTGGGAGAGGCACTAAAATAACAGTCCATgcga

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000158794

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00031209 lncRNA upstream 4650 36093561 ~ 36094319 (+) True XLOC_015636
TCONS_00033607 lncRNA upstream 20331 36072953 ~ 36078638 (+) True XLOC_015631
TCONS_00033606 lncRNA upstream 484671 35612555 ~ 35614298 (+) False XLOC_015623
TCONS_00031186 lncRNA upstream 493072 35603637 ~ 35605897 (+) False XLOC_015622
TCONS_00033278 lncRNA upstream 517678 35579580 ~ 35581291 (+) True XLOC_015619
TCONS_00033608 lncRNA downstream 81215 36180243 ~ 36367124 (+) False XLOC_015702
TCONS_00033609 lncRNA downstream 81215 36180243 ~ 36583275 (+) False XLOC_015702
TCONS_00033610 lncRNA downstream 145894 36244922 ~ 36247469 (+) True XLOC_015703
TCONS_00033279 lncRNA downstream 280211 36379239 ~ 36425187 (+) False XLOC_015704
TCONS_00033280 lncRNA downstream 325826 36424854 ~ 36471110 (+) True XLOC_015704
TCONS_00031202 mRNA upstream 19062 36046126 ~ 36079907 (+) False XLOC_015631
TCONS_00031203 mRNA upstream 22390 36046192 ~ 36076579 (+) False XLOC_015631
TCONS_00031201 mRNA upstream 77361 36015049 ~ 36021608 (+) True XLOC_015630
TCONS_00031199 mRNA upstream 77723 36004381 ~ 36021246 (+) False XLOC_015630
TCONS_00031200 mRNA upstream 84182 36007449 ~ 36014787 (+) False XLOC_015630
TCONS_00031229 mRNA downstream 4281 36103309 ~ 36155743 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031244 mRNA downstream 9974 36109002 ~ 36157911 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031253 mRNA downstream 13245 36112273 ~ 36157913 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031258 mRNA downstream 15166 36114194 ~ 36157913 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031275 mRNA downstream 22345 36121373 ~ 36157906 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031218 other upstream 157 36098750 ~ 36098812 (+) True XLOC_015645
TCONS_00031217 other upstream 572 36098341 ~ 36098397 (+) True XLOC_015644
TCONS_00031216 other upstream 922 36097984 ~ 36098047 (+) True XLOC_015643
TCONS_00031215 other upstream 1500 36097414 ~ 36097469 (+) True XLOC_015642
TCONS_00031214 other upstream 2182 36096728 ~ 36096787 (+) True XLOC_015641
TCONS_00031220 other downstream 182 36099210 ~ 36099272 (+) True XLOC_015647
TCONS_00031221 other downstream 877 36099905 ~ 36099964 (+) True XLOC_015648
TCONS_00031222 other downstream 1179 36100207 ~ 36100269 (+) True XLOC_015649
TCONS_00031223 other downstream 1437 36100465 ~ 36100527 (+) True XLOC_015650
TCONS_00031224 other downstream 2349 36101377 ~ 36101442 (+) True XLOC_015651