RNA id: TCONS_00031223



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00031223
length 63
RNA type TR_J_gene
GC content 0.43
exon number 1
gene id XLOC_015650
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 36100465 ~ 36100527 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TGACTTCATCTGGGCTCTACCAGATCTATTTTGGCTCTGGAACCAAACTCATAGTTGGAACAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000186087

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00031209 lncRNA upstream 6146 36093561 ~ 36094319 (+) True XLOC_015636
TCONS_00033607 lncRNA upstream 21827 36072953 ~ 36078638 (+) True XLOC_015631
TCONS_00033606 lncRNA upstream 486167 35612555 ~ 35614298 (+) False XLOC_015623
TCONS_00031186 lncRNA upstream 494568 35603637 ~ 35605897 (+) False XLOC_015622
TCONS_00033278 lncRNA upstream 519174 35579580 ~ 35581291 (+) True XLOC_015619
TCONS_00033608 lncRNA downstream 79716 36180243 ~ 36367124 (+) False XLOC_015702
TCONS_00033609 lncRNA downstream 79716 36180243 ~ 36583275 (+) False XLOC_015702
TCONS_00033610 lncRNA downstream 144395 36244922 ~ 36247469 (+) True XLOC_015703
TCONS_00033279 lncRNA downstream 278712 36379239 ~ 36425187 (+) False XLOC_015704
TCONS_00033280 lncRNA downstream 324327 36424854 ~ 36471110 (+) True XLOC_015704
TCONS_00031202 mRNA upstream 20558 36046126 ~ 36079907 (+) False XLOC_015631
TCONS_00031203 mRNA upstream 23886 36046192 ~ 36076579 (+) False XLOC_015631
TCONS_00031201 mRNA upstream 78857 36015049 ~ 36021608 (+) True XLOC_015630
TCONS_00031199 mRNA upstream 79219 36004381 ~ 36021246 (+) False XLOC_015630
TCONS_00031200 mRNA upstream 85678 36007449 ~ 36014787 (+) False XLOC_015630
TCONS_00031229 mRNA downstream 2782 36103309 ~ 36155743 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031244 mRNA downstream 8475 36109002 ~ 36157911 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031253 mRNA downstream 11746 36112273 ~ 36157913 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031258 mRNA downstream 13667 36114194 ~ 36157913 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031275 mRNA downstream 20846 36121373 ~ 36157906 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031222 other upstream 196 36100207 ~ 36100269 (+) True XLOC_015649
TCONS_00031221 other upstream 501 36099905 ~ 36099964 (+) True XLOC_015648
TCONS_00031220 other upstream 1193 36099210 ~ 36099272 (+) True XLOC_015647
TCONS_00031219 other upstream 1437 36098969 ~ 36099028 (+) True XLOC_015646
TCONS_00031218 other upstream 1653 36098750 ~ 36098812 (+) True XLOC_015645
TCONS_00031224 other downstream 850 36101377 ~ 36101442 (+) True XLOC_015651
TCONS_00031225 other downstream 1235 36101762 ~ 36101824 (+) True XLOC_015652
TCONS_00031226 other downstream 1534 36102061 ~ 36102123 (+) True XLOC_015653
TCONS_00031227 other downstream 2081 36102608 ~ 36102670 (+) True XLOC_015654
TCONS_00031228 other downstream 2327 36102854 ~ 36102916 (+) True XLOC_015655