RNA id: TCONS_00031279


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00031279
length 60
RNA type TR_J_gene
GC content 0.35
exon number 1
gene id XLOC_015697
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 36122605 ~ 36122664 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGACTAACAACGTGGGACGTATGATATTTGGAAAAGGAACAAAACTTATTGTTGATTCAG

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000159979

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00031209 lncRNA upstream 28286 36093561 ~ 36094319 (+) True XLOC_015636
TCONS_00033607 lncRNA upstream 43967 36072953 ~ 36078638 (+) True XLOC_015631
TCONS_00033606 lncRNA upstream 508307 35612555 ~ 35614298 (+) False XLOC_015623
TCONS_00031186 lncRNA upstream 516708 35603637 ~ 35605897 (+) False XLOC_015622
TCONS_00033278 lncRNA upstream 541314 35579580 ~ 35581291 (+) True XLOC_015619
TCONS_00033608 lncRNA downstream 57579 36180243 ~ 36367124 (+) False XLOC_015702
TCONS_00033609 lncRNA downstream 57579 36180243 ~ 36583275 (+) False XLOC_015702
TCONS_00033610 lncRNA downstream 122258 36244922 ~ 36247469 (+) True XLOC_015703
TCONS_00033279 lncRNA downstream 256575 36379239 ~ 36425187 (+) False XLOC_015704
TCONS_00033280 lncRNA downstream 302190 36424854 ~ 36471110 (+) True XLOC_015704
TCONS_00031202 mRNA upstream 42698 36046126 ~ 36079907 (+) False XLOC_015631
TCONS_00031203 mRNA upstream 46026 36046192 ~ 36076579 (+) False XLOC_015631
TCONS_00031201 mRNA upstream 100997 36015049 ~ 36021608 (+) True XLOC_015630
TCONS_00031199 mRNA upstream 101359 36004381 ~ 36021246 (+) False XLOC_015630
TCONS_00031200 mRNA upstream 107818 36007449 ~ 36014787 (+) False XLOC_015630
TCONS_00031284 mRNA downstream 483355 36606019 ~ 36608762 (+) False XLOC_015706
TCONS_00031285 mRNA downstream 485723 36608387 ~ 36635858 (+) False XLOC_015706
TCONS_00031286 mRNA downstream 494166 36616830 ~ 36636751 (+) False XLOC_015706
TCONS_00031287 mRNA downstream 494166 36616830 ~ 36636866 (+) False XLOC_015706
TCONS_00031288 mRNA downstream 497347 36620011 ~ 36635859 (+) True XLOC_015706
TCONS_00031278 other upstream 233 36122310 ~ 36122372 (+) True XLOC_015696
TCONS_00031277 other upstream 829 36121720 ~ 36121776 (+) True XLOC_015695
TCONS_00031276 other upstream 1169 36121374 ~ 36121436 (+) True XLOC_015656
TCONS_00031274 other upstream 1659 36120881 ~ 36120946 (+) True XLOC_015694
TCONS_00031273 other upstream 1929 36120620 ~ 36120676 (+) True XLOC_015693
TCONS_00031280 other downstream 392 36123056 ~ 36123115 (+) True XLOC_015698
TCONS_00031281 other downstream 1207 36123871 ~ 36123931 (+) True XLOC_015699
TCONS_00031282 other downstream 1559 36124223 ~ 36124282 (+) True XLOC_015700
TCONS_00031283 other downstream 2091 36124755 ~ 36124817 (+) True XLOC_015701
TCONS_00031294 other downstream 630985 36753649 ~ 36753758 (+) True XLOC_015713