RNA id: TCONS_00031283


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00031283
length 63
RNA type TR_J_gene
GC content 0.37
exon number 1
gene id XLOC_015701
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 36124755 ~ 36124817 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGACTATGACTACAATGGGACGTATGATATTTGGAAAAGGAACAAAACTTACTGTCCATTCAG

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000170691

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00031209 lncRNA upstream 30436 36093561 ~ 36094319 (+) True XLOC_015636
TCONS_00033607 lncRNA upstream 46117 36072953 ~ 36078638 (+) True XLOC_015631
TCONS_00033606 lncRNA upstream 510457 35612555 ~ 35614298 (+) False XLOC_015623
TCONS_00031186 lncRNA upstream 518858 35603637 ~ 35605897 (+) False XLOC_015622
TCONS_00033278 lncRNA upstream 543464 35579580 ~ 35581291 (+) True XLOC_015619
TCONS_00033608 lncRNA downstream 55426 36180243 ~ 36367124 (+) False XLOC_015702
TCONS_00033609 lncRNA downstream 55426 36180243 ~ 36583275 (+) False XLOC_015702
TCONS_00033610 lncRNA downstream 120105 36244922 ~ 36247469 (+) True XLOC_015703
TCONS_00033279 lncRNA downstream 254422 36379239 ~ 36425187 (+) False XLOC_015704
TCONS_00033280 lncRNA downstream 300037 36424854 ~ 36471110 (+) True XLOC_015704
TCONS_00031202 mRNA upstream 44848 36046126 ~ 36079907 (+) False XLOC_015631
TCONS_00031203 mRNA upstream 48176 36046192 ~ 36076579 (+) False XLOC_015631
TCONS_00031201 mRNA upstream 103147 36015049 ~ 36021608 (+) True XLOC_015630
TCONS_00031199 mRNA upstream 103509 36004381 ~ 36021246 (+) False XLOC_015630
TCONS_00031200 mRNA upstream 109968 36007449 ~ 36014787 (+) False XLOC_015630
TCONS_00031284 mRNA downstream 481202 36606019 ~ 36608762 (+) False XLOC_015706
TCONS_00031285 mRNA downstream 483570 36608387 ~ 36635858 (+) False XLOC_015706
TCONS_00031286 mRNA downstream 492013 36616830 ~ 36636751 (+) False XLOC_015706
TCONS_00031287 mRNA downstream 492013 36616830 ~ 36636866 (+) False XLOC_015706
TCONS_00031288 mRNA downstream 495194 36620011 ~ 36635859 (+) True XLOC_015706
TCONS_00031282 other upstream 473 36124223 ~ 36124282 (+) True XLOC_015700
TCONS_00031281 other upstream 824 36123871 ~ 36123931 (+) True XLOC_015699
TCONS_00031280 other upstream 1640 36123056 ~ 36123115 (+) True XLOC_015698
TCONS_00031279 other upstream 2091 36122605 ~ 36122664 (+) True XLOC_015697
TCONS_00031278 other upstream 2383 36122310 ~ 36122372 (+) True XLOC_015696
TCONS_00031294 other downstream 628832 36753649 ~ 36753758 (+) True XLOC_015713
TCONS_00031307 other downstream 1015657 37140474 ~ 37143617 (+) True XLOC_015719
TCONS_00031312 other downstream 1067624 37192441 ~ 37201587 (+) True XLOC_015720
TCONS_00031331 other downstream 1711802 37836619 ~ 37836920 (+) False XLOC_015734
TCONS_00031335 other downstream 1749954 37874771 ~ 37878304 (+) False XLOC_015735